More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0194 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0194  ATPase domain-containing protein  100 
 
 		 549 aa  1059    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.357239  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1933  ATPase domain-containing protein  48.68 
 
 		 535 aa  428  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493372  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2855  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.13 
 
 		 712 aa  279  9e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35660  signal transduction histidine kinase  41.51 
 
 		 572 aa  276  5e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0866  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.43 
 
 		 555 aa  269  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.917443  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0977  histidine kinase  35.67 
 
 		 551 aa  266  5e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0254133 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2879  histidine kinase  37.12 
 
 		 553 aa  251  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27560  signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 597 aa  241  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.972218  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3794  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 575 aa  241  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08080  signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 569 aa  239  6.999999999999999e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.672311  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1931  ATPase domain-containing protein  59.11 
 
 		 423 aa  231  3e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.508093  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 		 587 aa  221  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16710  signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 554 aa  219  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0521739 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 589 aa  189  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.306932  normal  0.158909 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.11 
 
 		 1010 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 		 625 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22580  signal transduction histidine kinase  40.88 
 
 		 576 aa  181  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.162219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 885 aa  181  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.03 
 
 		 408 aa  180  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2895  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 539 aa  173  9e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.939958  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 594 aa  171  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4318  ATPase domain-containing protein  43.35 
 
 		 593 aa  167  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819924  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1340  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 		 682 aa  167  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.725746  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4317  ATPase domain-containing protein  43.29 
 
 		 600 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 		 489 aa  163  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 		 827 aa  163  8.000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 458 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0334  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.75 
 
 		 492 aa  161  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.091816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 582 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 		 585 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  29.64 
 
 		 565 aa  160  5e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  32.87 
 
 		 591 aa  159  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 600 aa  158  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 		 590 aa  158  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 591 aa  157  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 		 958 aa  157  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  29.05 
 
 		 554 aa  157  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 554 aa  157  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 		 944 aa  155  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 		 639 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 709 aa  155  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4258  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.89 
 
 		 663 aa  154  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.267585 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 585 aa  154  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 		 639 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 		 412 aa  153  8e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 701 aa  153  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  39.57 
 
 		 461 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  39.57 
 
 		 461 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 571 aa  152  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 		 639 aa  152  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 596 aa  152  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 		 418 aa  151  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  38.7 
 
 		 461 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 602 aa  151  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3793  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 		 664 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.191798 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5978  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.49 
 
 		 656 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.410257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 589 aa  151  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 587 aa  150  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3990  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.49 
 
 		 666 aa  151  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4377  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.49 
 
 		 666 aa  151  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 590 aa  150  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.49 
 
 		 672 aa  150  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.934605  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 815 aa  150  6e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  29.95 
 
 		 587 aa  150  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  29.95 
 
 		 587 aa  150  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  30.22 
 
 		 587 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  30.22 
 
 		 587 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  30.22 
 
 		 587 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2661  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 602 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  30.22 
 
 		 587 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 608 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  39 
 
 		 346 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  30.22 
 
 		 587 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1928  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 920 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1741  histidine kinase  34.03 
 
 		 356 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000297787  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 359 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  30.22 
 
 		 587 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  30.22 
 
 		 587 aa  148  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  36.8 
 
 		 584 aa  147  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 641 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1825  histidine kinase  32.84 
 
 		 357 aa  147  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2414  multisensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 505 aa  146  8.000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.40518  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0045  histidine kinase  41.2 
 
 		 370 aa  146  9e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1963  sensor histidine kinase  32.84 
 
 		 357 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553892  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1926  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 697 aa  145  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 581 aa  146  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 1039 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 593 aa  145  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  38.67 
 
 		 464 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 737 aa  145  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.224344 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 606 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 637 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3365  sensor histidine kinase  32.84 
 
 		 357 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  hitchhiker  0.0000000000000135665 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 		 646 aa  145  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 		 2161 aa  145  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 640 aa  144  3e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>