More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1136 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1136  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 608 aa  1217    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  57.48 
 
 		 466 aa  291  2e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 800 aa  270  8e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0884  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 807 aa  269  1e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00331872  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.41 
 
 		 903 aa  256  6e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.644945  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0324  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.38 
 
 		 464 aa  254  3e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.21 
 
 		 628 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.53 
 
 		 625 aa  244  3e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0157  multi-sensor signal transduction histidine kinase  58.06 
 
 		 1329 aa  244  5e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.88 
 
 		 735 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1707  GAF sensor signal transduction histidine kinase  51.52 
 
 		 535 aa  227  6e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.366818  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 		 659 aa  226  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0519  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.14 
 
 		 531 aa  226  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1528  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.03 
 
 		 659 aa  220  6e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.98 
 
 		 629 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 		 793 aa  216  9e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.73474  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 593 aa  212  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.51 
 
 		 576 aa  210  5e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.56 
 
 		 543 aa  209  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.624689  normal  0.503479 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2205  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.19 
 
 		 466 aa  194  6e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1464  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.8 
 
 		 579 aa  190  7e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2222  histidine kinase  42.8 
 
 		 605 aa  181  4e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0226681 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2299  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 670 aa  179  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465317  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1777  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 477 aa  172  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  33.21 
 
 		 1062 aa  159  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  32.25 
 
 		 1061 aa  156  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 		 592 aa  150  6e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0186  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  50.39 
 
 		 740 aa  133  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.789311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 793 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 991 aa  131  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.22 
 
 		 1578 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.9 
 
 		 1611 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 		 953 aa  124  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2108  multisensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 492 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2466  putative PAS/PAC sensor protein  47.9 
 
 		 558 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  28.96 
 
 		 1028 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.35 
 
 		 807 aa  121  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.672924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.01 
 
 		 1229 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.75 
 
 		 1078 aa  118  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3161  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 437 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.8 
 
 		 1127 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2523  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 		 1194 aa  117  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 767 aa  117  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2414  multisensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 		 505 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.40518  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1166  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.54 
 
 		 507 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3655  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 858 aa  113  9e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.87 
 
 		 1501 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 		 709 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 		 462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2815  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 		 412 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0667  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.66 
 
 		 929 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 		 1055 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 		 761 aa  110  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2634  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.26 
 
 		 451 aa  110  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0932991  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29 
 
 		 1088 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 1758 aa  109  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 		 1350 aa  110  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 813 aa  110  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.86 
 
 		 919 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.06 
 
 		 1433 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 		 891 aa  109  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00177504  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.54 
 
 		 1069 aa  109  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 603 aa  108  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3664  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 		 708 aa  107  7e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1800  histidine kinase  31.87 
 
 		 588 aa  107  9e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2133  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 678 aa  106  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 1291 aa  106  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  26.2 
 
 		 1417 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2720  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 407 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.94 
 
 		 1808 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.31 
 
 		 1131 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 		 839 aa  105  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1775  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.41 
 
 		 510 aa  105  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0981  putative sensor/response regulator hybrid  26.59 
 
 		 1418 aa  104  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195382  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0201  iron dependent repressor  35.4 
 
 		 715 aa  104  5e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.132112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 638 aa  104  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.679676  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.33 
 
 		 1659 aa  104  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0262  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 523 aa  104  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0211  sensor histidine kinase  25.29 
 
 		 506 aa  103  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0352661  normal  0.776224 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2356  PAS sensor protein  31.79 
 
 		 668 aa  104  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621519  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.81 
 
 		 1287 aa  103  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0693  sensory box histidine kinase  29.88 
 
 		 602 aa  103  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.958566  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 		 655 aa  103  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 		 621 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 931 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339388  normal  0.130033 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1264  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 561 aa  103  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.3 
 
 		 761 aa  103  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.7 
 
 		 575 aa  103  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.41 
 
 		 1027 aa  103  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2352  histidine kinase  34.8 
 
 		 387 aa  102  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 		 1267 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1409  Signal transduction histidine kinase-like  26.24 
 
 		 685 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.78 
 
 		 883 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2855  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.35 
 
 		 712 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.69 
 
 		 865 aa  102  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.14 
 
 		 1207 aa  101  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03428  PAS signal transduction protein  23.82 
 
 		 962 aa  101  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.78 
 
 		 765 aa  101  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 770 aa  101  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4365  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 514 aa  101  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108097  normal  0.083954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>