More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0211 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0211  sensor histidine kinase  100 
 
 
506 aa  1034    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0352661  normal  0.776224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0214  aerobic respiration sensor-response protein; histidine protein kinase/phosphatase, sensor for arcA  49.6 
 
 
511 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257861  normal  0.726877 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
569 aa  166  6.9999999999999995e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0992  two-component sensor histidine kinase  41.95 
 
 
696 aa  152  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0439814  normal  0.153335 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3217  two-component sensor histidine kinase  29.09 
 
 
725 aa  146  9e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5435  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 
737 aa  144  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.72924  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1007  sensory box histidine kinase  26.78 
 
 
812 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5566  histidine kinase  33.19 
 
 
403 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.430665 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0908  sensory box histidine kinase  30.47 
 
 
723 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1434  sensory box histidine kinase  26.16 
 
 
821 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0174  sensory box histidine kinase  26.16 
 
 
821 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0382  sensory box histidine kinase  26.41 
 
 
723 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1844  sensory box histidine kinase  30.47 
 
 
723 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1934  two-component sensor kinase protein  30.47 
 
 
723 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0474  sensory box histidine kinase  26.16 
 
 
821 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
761 aa  125  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.69 
 
 
704 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352611  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3029  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 
461 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20083  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1660  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 
781 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.55 
 
 
761 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0667  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
929 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0123  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
506 aa  118  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489937  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3363  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 
515 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.11 
 
 
1669 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 
575 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.29 
 
 
502 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36757  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.94 
 
 
1068 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1141  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 
520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3146  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.77 
 
 
521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0386  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 
674 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.963585  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.94 
 
 
712 aa  114  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0547872  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0994  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 
640 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620121  normal  0.0418978 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3046  two-component sensor histidine kinase  30.8 
 
 
515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3846  normal  0.30289 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 
527 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.521326 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 
527 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151228  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 
1383 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2733  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 
527 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.219338  normal  0.282473 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0103  sensor histidine kinase  30.3 
 
 
379 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.689061  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2336  PAS sensor protein  29.48 
 
 
350 aa  110  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.870969  normal  0.135011 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 
1028 aa  110  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  unclonable  0.0000177894 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2450  PAS sensor signal transduction histidine kinase  24.74 
 
 
499 aa  109  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
681 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.4 
 
 
683 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2607  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
1144 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22960  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  28.45 
 
 
552 aa  108  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 
510 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.475252  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.87 
 
 
628 aa  107  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3823  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
498 aa  107  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177602  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5080  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 
677 aa  107  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1875  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  25.75 
 
 
501 aa  107  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.07 
 
 
384 aa  106  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00811703  normal  0.288098 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2216  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 
458 aa  106  9e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.247022  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.16 
 
 
1807 aa  106  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.869779  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1810  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.12 
 
 
488 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.081179 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 
767 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2335  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 
504 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 
506 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 
883 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 
361 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.121387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4420  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.71 
 
 
922 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0348998  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1125  histidine kinase  30.54 
 
 
564 aa  104  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  25.3 
 
 
368 aa  103  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
510 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1237  chemotaxis response regulator (methyltransferase)  26.15 
 
 
1618 aa  103  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 
1267 aa  103  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2531  sensory box histidine kinase  25.95 
 
 
1053 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.606569  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
1195 aa  103  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1994  histidine kinase  29.92 
 
 
387 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.376445  hitchhiker  0.00440814 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2057  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 
352 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.566261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8461  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  32 
 
 
528 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 
713 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.908922  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0038  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 
1043 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.11404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3820  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.37 
 
 
881 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 
828 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.419482 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0555  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.32 
 
 
416 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.564143 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0051  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.87 
 
 
651 aa  101  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2077  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein (sensor for arcA)  29.62 
 
 
492 aa  101  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0651522  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3510  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.85 
 
 
521 aa  101  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.269968 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1264  histidine kinase  28.93 
 
 
421 aa  101  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.557954  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1656  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.35 
 
 
478 aa  101  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.999121 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3435  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 
605 aa  100  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.188279 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0331  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.18 
 
 
929 aa  100  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.590564 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2988  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
529 aa  100  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.633654  normal  0.687189 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 
838 aa  100  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1796  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 
756 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.232536 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 
748 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4842  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.92 
 
 
1339 aa  99.4  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0291  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 
543 aa  99.8  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.808463 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 
1064 aa  99.8  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 
1140 aa  99.4  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3347  sensor histidine kinase  23.59 
 
 
1020 aa  99.8  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04304  two-component system sensor protein  28.26 
 
 
603 aa  99  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4352  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.29 
 
 
1166 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1092  aerobic respiration sensor-response protein; histidine protein kinase  31.58 
 
 
584 aa  98.6  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.962322  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5571  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 
540 aa  98.6  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.982003  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3730  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.94 
 
 
978 aa  99  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208606  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2531  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 
880 aa  99  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 
786 aa  98.6  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0324  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 
424 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.046409  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.25 
 
 
642 aa  98.6  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>