More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0992 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0992  two-component sensor histidine kinase  100 
 
 		 696 aa  1426    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0439814  normal  0.153335 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0211  sensor histidine kinase  41.95 
 
 		 506 aa  152  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0352661  normal  0.776224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0214  aerobic respiration sensor-response protein; histidine protein kinase/phosphatase, sensor for arcA  38.21 
 
 		 511 aa  150  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257861  normal  0.726877 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1988  sensor protein for response regulator AtoC  26.96 
 
 		 715 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.431904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5435  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 737 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.72924  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  25.19 
 
 		 708 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2391  Diverse 7TM receptor transmembrane region  24.12 
 
 		 726 aa  132  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 569 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  26.9 
 
 		 730 aa  127  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2796  phosphoglycerate transport; protein for signal transmission  25.75 
 
 		 724 aa  123  9e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000463972  normal  0.015669 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2799  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  25 
 
 		 716 aa  122  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000869  normal  0.160664 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2800  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  24.13 
 
 		 696 aa  122  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120614  normal  0.163305 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3217  two-component sensor histidine kinase  34.98 
 
 		 725 aa  122  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2797  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  23.34 
 
 		 707 aa  119  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000203115  normal  0.0370017 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 		 829 aa  117  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.254263  normal  0.520462 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3917  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 683 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.465717 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1222  signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 		 650 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.495402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3468  sensor histidine kinase  25.45 
 
 		 651 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0103  sensor histidine kinase  32.3 
 
 		 379 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.689061  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2267  hypothetical protein  28.57 
 
 		 590 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.22249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1667  histidine kinase  30 
 
 		 537 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0824698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 1153 aa  110  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0123  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 506 aa  110  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489937  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1994  histidine kinase  30.04 
 
 		 387 aa  107  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.376445  hitchhiker  0.00440814 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 435 aa  106  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.652277 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 941 aa  105  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.109629  normal  0.20707 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 738 aa  105  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5638  histidine kinase  28.4 
 
 		 540 aa  104  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1637  sensor histidine kinase  24.52 
 
 		 656 aa  104  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0556277  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 483 aa  103  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0404114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4276  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 		 779 aa  103  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4322  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 		 969 aa  103  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3820  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 		 881 aa  103  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  21.77 
 
 		 802 aa  102  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 628 aa  102  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5566  histidine kinase  29.92 
 
 		 403 aa  102  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.430665 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3029  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 461 aa  101  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0675  aerobic respiration sensor-response protein; histidine protein kinase  24.4 
 
 		 646 aa  100  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.779748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1725  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 407 aa  100  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0053  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 444 aa  100  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3012  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 556 aa  100  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0214699  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0009  sensory box histidine kinase  29.12 
 
 		 499 aa  99.8  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3713  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 713 aa  99.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000481 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0474  sensory box histidine kinase  28.26 
 
 		 821 aa  99.8  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1434  sensory box histidine kinase  28.26 
 
 		 821 aa  99.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1007  sensory box histidine kinase  28.7 
 
 		 812 aa  99  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0174  sensory box histidine kinase  28.26 
 
 		 821 aa  99.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0667  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 		 929 aa  99.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0331  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 929 aa  99.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.590564 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1934  two-component sensor kinase protein  28.26 
 
 		 723 aa  98.6  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0908  sensory box histidine kinase  28.26 
 
 		 723 aa  98.6  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0382  sensory box histidine kinase  28.26 
 
 		 723 aa  98.6  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 714 aa  98.6  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.523166 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1844  sensory box histidine kinase  28.45 
 
 		 723 aa  99  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1237  chemotaxis response regulator (methyltransferase)  31.58 
 
 		 1618 aa  98.6  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1596  Diverse 7TM receptor transmembrane region  22.67 
 
 		 660 aa  98.2  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.351374 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3432  histidine kinase  28.83 
 
 		 796 aa  97.8  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 616 aa  97.4  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.459436  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2288  sensor histidine kinase  26.02 
 
 		 520 aa  97.4  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2444  sensor histidine kinase  25.23 
 
 		 610 aa  97.4  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.119384  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 761 aa  97.1  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2049  histidine kinase  27.45 
 
 		 494 aa  96.3  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 361 aa  96.3  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.121387  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3195  histidine kinase  24.23 
 
 		 354 aa  95.9  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107163  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3091  sensor histidine kinase  31.23 
 
 		 444 aa  96.3  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2742  sensory box histidine kinase  27.87 
 
 		 363 aa  95.5  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.507187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.55 
 
 		 809 aa  95.5  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4218  diguanylate cyclase  22.89 
 
 		 631 aa  95.5  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1116  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  26.97 
 
 		 496 aa  95.5  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2794  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 		 767 aa  95.1  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.470571 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1714  ATP-binding region ATPase domain protein  22.99 
 
 		 666 aa  95.1  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84327  hitchhiker  0.000293695 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 778 aa  94.7  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.260825 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2176  histidine kinase  28.17 
 
 		 520 aa  94.7  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.955283 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0058  diguanylate cyclase  22.73 
 
 		 565 aa  94.4  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.714624  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3347  sensor histidine kinase  31.01 
 
 		 1020 aa  94.4  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 		 704 aa  94.4  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352611  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 799 aa  94  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3133  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 543 aa  94  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.863254  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3820  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 755 aa  94  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0555  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 416 aa  94  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.564143 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5416  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 632 aa  94  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0324  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 424 aa  93.6  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.046409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0223  sensor histidine kinase  24.18 
 
 		 655 aa  93.6  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.142406  normal  0.0289163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2761  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 679 aa  93.6  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.47205 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0344  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 730 aa  93.6  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0059666  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 		 591 aa  93.6  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 		 502 aa  93.2  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2762  histidine kinase  26.86 
 
 		 558 aa  93.2  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2571  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.78 
 
 		 406 aa  92.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.156881 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01275  putative two-component sensor histidine kinase  28.36 
 
 		 503 aa  92.8  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.590202  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1083  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 		 973 aa  92.8  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2567  sensor histidine kinase  28 
 
 		 583 aa  92  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  21.48 
 
 		 1042 aa  92.4  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 		 1195 aa  91.7  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2666  histidine kinase  29.41 
 
 		 586 aa  91.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0592074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2057  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 352 aa  91.7  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.566261 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 604 aa  91.7  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22960  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  24.19 
 
 		 552 aa  91.7  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0262  bacteriophytochrome-like protein  28.52 
 
 		 505 aa  91.7  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.268371 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2077  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein (sensor for arcA)  28.88 
 
 		 492 aa  91.3  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0651522  normal  0.191572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>