More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5435 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5435  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 737 aa  1535    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.72924  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3217  two-component sensor histidine kinase  41.63 
 
 		 725 aa  187  7e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 569 aa  161  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5566  histidine kinase  37.66 
 
 		 403 aa  150  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.430665 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0211  sensor histidine kinase  27.86 
 
 		 506 aa  144  7e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0352661  normal  0.776224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0992  two-component sensor histidine kinase  35.07 
 
 		 696 aa  138  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0439814  normal  0.153335 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0214  aerobic respiration sensor-response protein; histidine protein kinase/phosphatase, sensor for arcA  27.53 
 
 		 511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257861  normal  0.726877 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0123  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 506 aa  133  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489937  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 		 1807 aa  124  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.869779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.12 
 
 		 838 aa  119  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2057  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 352 aa  114  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.566261 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1810  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.19 
 
 		 488 aa  114  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.081179 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  23.67 
 
 		 1535 aa  112  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0103  sensor histidine kinase  28.69 
 
 		 379 aa  110  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.689061  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.99 
 
 		 883 aa  105  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.09 
 
 		 761 aa  103  8e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1934  two-component sensor kinase protein  27.32 
 
 		 723 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0474  sensory box histidine kinase  27.32 
 
 		 821 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.34 
 
 		 817 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1434  sensory box histidine kinase  27.32 
 
 		 821 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0174  sensory box histidine kinase  27.32 
 
 		 821 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 502 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1844  sensory box histidine kinase  27.32 
 
 		 723 aa  102  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0382  sensory box histidine kinase  27.32 
 
 		 723 aa  102  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1007  sensory box histidine kinase  27.47 
 
 		 812 aa  102  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0908  sensory box histidine kinase  27.32 
 
 		 723 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2077  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein (sensor for arcA)  28.69 
 
 		 492 aa  101  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0651522  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 		 1267 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0693  sensory box histidine kinase  25.91 
 
 		 602 aa  100  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.958566  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.04 
 
 		 628 aa  99.4  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2607  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 1144 aa  99.8  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.05 
 
 		 821 aa  98.2  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1531  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.8 
 
 		 643 aa  98.2  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2450  PAS sensor signal transduction histidine kinase  23.78 
 
 		 499 aa  97.8  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.62 
 
 		 626 aa  97.8  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 1383 aa  97.4  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.25 
 
 		 1195 aa  96.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 		 674 aa  97.1  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.74 
 
 		 1363 aa  97.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3012  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 556 aa  96.3  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0214699  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5080  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 		 677 aa  95.9  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1315  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 		 365 aa  95.5  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2639  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 		 396 aa  95.5  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.717158 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  24.25 
 
 		 778 aa  95.5  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1994  histidine kinase  25.82 
 
 		 387 aa  95.5  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.376445  hitchhiker  0.00440814 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.78 
 
 		 532 aa  94  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.030472 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1667  histidine kinase  25.8 
 
 		 537 aa  93.2  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0824698 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 		 767 aa  92.8  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.07 
 
 		 656 aa  92.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.05 
 
 		 1267 aa  92.8  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3211  bacteriophytochrome-like protein  24.9 
 
 		 842 aa  92.4  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.880007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3432  histidine kinase  26.95 
 
 		 796 aa  91.7  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.44 
 
 		 572 aa  91.7  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3487  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.64 
 
 		 717 aa  91.7  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 		 713 aa  91.3  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.908922  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 		 681 aa  90.9  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5571  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 540 aa  90.9  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.982003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1676  histidine kinase  21.94 
 
 		 881 aa  90.9  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3347  sensor histidine kinase  19.6 
 
 		 1020 aa  90.5  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 		 828 aa  90.1  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.419482 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 		 770 aa  90.5  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.72 
 
 		 384 aa  89.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00811703  normal  0.288098 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 758 aa  89.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3046  two-component sensor histidine kinase  27.27 
 
 		 515 aa  89.7  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3846  normal  0.30289 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0543  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.64 
 
 		 717 aa  89.7  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2818  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 		 769 aa  89.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0945314 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 779 aa  89  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689927  normal  0.970382 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 		 1140 aa  89  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1092  aerobic respiration sensor-response protein; histidine protein kinase  26.2 
 
 		 584 aa  89  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.962322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0051  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.2 
 
 		 651 aa  89  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 		 612 aa  88.2  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 368 aa  88.6  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1289  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 		 662 aa  88.6  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1145  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.86 
 
 		 532 aa  88.6  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1148  sensor histidine kinase  25.4 
 
 		 604 aa  88.2  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3463  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.2 
 
 		 1333 aa  88.2  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.245922 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2154  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 572 aa  88.2  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.32555 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1050  sensory box histidine kinase  25.68 
 
 		 452 aa  87.8  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 941 aa  87.4  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.109629  normal  0.20707 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0103  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.46 
 
 		 639 aa  87.4  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0038  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.73 
 
 		 1043 aa  87.4  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11404 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2907  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 		 520 aa  87.4  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 515 aa  86.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0994  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.5 
 
 		 640 aa  87  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620121  normal  0.0418978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 527 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151228  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 527 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.521326 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1141  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.44 
 
 		 520 aa  87  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2733  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 527 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.219338  normal  0.282473 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5079  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.03 
 
 		 695 aa  87  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.929766 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3195  histidine kinase  26.55 
 
 		 354 aa  86.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107163  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4338  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.4 
 
 		 430 aa  86.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.743404  decreased coverage  0.000431263 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 		 738 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0542  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.78 
 
 		 719 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4276  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.02 
 
 		 779 aa  86.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11543  sensory transduction histidine kinase  22.03 
 
 		 952 aa  86.3  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.166055  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11588  two-component sensor histidine kinase  27.35 
 
 		 403 aa  86.7  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.339726  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0544  sensory box histidine kinase  24.19 
 
 		 717 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.69 
 
 		 862 aa  85.9  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.57 
 
 		 631 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.01 
 
 		 881 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>