More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5571 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5571  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 540 aa  1095    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.982003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 		 1064 aa  231  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 683 aa  225  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 		 883 aa  225  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.8 
 
 		 793 aa  222  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 		 960 aa  219  7.999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 1195 aa  216  5.9999999999999996e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.68 
 
 		 532 aa  210  5e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.030472 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 		 767 aa  210  5e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2774  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 535 aa  209  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 1177 aa  208  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 626 aa  207  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.31 
 
 		 789 aa  206  6e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.179581  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0667  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.84 
 
 		 929 aa  206  9e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 502 aa  206  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 1562 aa  206  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2907  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 		 520 aa  206  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 		 368 aa  205  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4420  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 922 aa  205  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0348998  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 		 639 aa  205  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 		 761 aa  204  4e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3347  sensor histidine kinase  32.81 
 
 		 1020 aa  203  5e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 1669 aa  203  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1656  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 		 478 aa  203  6e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.999121 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0994  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.61 
 
 		 640 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620121  normal  0.0418978 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.77 
 
 		 380 aa  201  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.21 
 
 		 838 aa  200  5e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.21 
 
 		 817 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4643  histidine kinase  44.64 
 
 		 421 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.318194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.93 
 
 		 515 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 		 821 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2179  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.55 
 
 		 710 aa  197  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.312055 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.58 
 
 		 642 aa  197  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 786 aa  197  5.000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.2 
 
 		 1965 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 		 1140 aa  196  8.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5034  histidine kinase  44.93 
 
 		 498 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1125  histidine kinase  46.29 
 
 		 564 aa  196  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 361 aa  195  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.121387  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 575 aa  194  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3202  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 896 aa  194  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6522  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.84 
 
 		 556 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1083  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 		 973 aa  194  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0970  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.8 
 
 		 729 aa  194  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3820  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 881 aa  194  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1660  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 781 aa  193  8e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 770 aa  193  8e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0908  sensory box histidine kinase  43.59 
 
 		 723 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0382  sensory box histidine kinase  43.59 
 
 		 723 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5080  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 		 677 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1844  sensory box histidine kinase  43.59 
 
 		 723 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1934  two-component sensor kinase protein  42.11 
 
 		 723 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0174  sensory box histidine kinase  43.59 
 
 		 821 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1434  sensory box histidine kinase  43.59 
 
 		 821 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2990  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 1253 aa  192  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450084  normal  0.707823 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 		 1267 aa  191  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 		 807 aa  192  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.309689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0474  sensory box histidine kinase  43.59 
 
 		 821 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 		 681 aa  191  4e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 1118 aa  189  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3363  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 515 aa  189  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2607  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 1144 aa  189  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8461  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  44.17 
 
 		 528 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 		 551 aa  188  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1875  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 501 aa  189  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2684  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 506 aa  188  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 1532 aa  186  7e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4114  histidine kinase  42.74 
 
 		 268 aa  186  8e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0596823  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3954  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 		 792 aa  186  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3852  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 		 765 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1007  sensory box histidine kinase  37.64 
 
 		 812 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 628 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3150  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.03 
 
 		 408 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 566 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2062  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 951 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.275424  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 809 aa  185  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2216  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 458 aa  184  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.247022  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 		 628 aa  184  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117845  decreased coverage  0.00612296 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5232  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 		 698 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.95 
 
 		 525 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0291  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.58 
 
 		 543 aa  182  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.808463 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 798 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.505413  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1862  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 869 aa  182  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.557725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2215  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 		 810 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.64 
 
 		 527 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.521326 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.64 
 
 		 527 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151228  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2733  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.64 
 
 		 527 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.219338  normal  0.282473 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4119  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 380 aa  179  9e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1725  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.04 
 
 		 407 aa  179  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3188  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 		 810 aa  178  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.13 
 
 		 1359 aa  178  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 		 674 aa  177  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1080  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 		 1128 aa  177  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22960  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  43.36 
 
 		 552 aa  177  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.81 
 
 		 553 aa  177  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199199  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 		 760 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1901  two-component sensor histidine kinase  29.95 
 
 		 931 aa  177  5e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0313083  normal  0.0871787 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4111  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 		 760 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2049  histidine kinase  42.86 
 
 		 494 aa  177  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3046  two-component sensor histidine kinase  31.27 
 
 		 515 aa  176  7e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3846  normal  0.30289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>