More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0103 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0103  sensor histidine kinase  100 
 
 		 379 aa  755    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.689061  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5566  histidine kinase  41.05 
 
 		 403 aa  280  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.430665 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1994  histidine kinase  36.65 
 
 		 387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.376445  hitchhiker  0.00440814 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2057  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 352 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.566261 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 569 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2403  ATP-binding region, ATPase-like  30.16 
 
 		 776 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0308443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3425  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 775 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0531418  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4451  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 775 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1221  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.14 
 
 		 532 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178023 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3217  two-component sensor histidine kinase  32.75 
 
 		 725 aa  120  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2684  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 		 506 aa  119  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 713 aa  117  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.908922  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 779 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689927  normal  0.970382 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0214  aerobic respiration sensor-response protein; histidine protein kinase/phosphatase, sensor for arcA  31.33 
 
 		 511 aa  116  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257861  normal  0.726877 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0992  two-component sensor histidine kinase  32.3 
 
 		 696 aa  116  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0439814  normal  0.153335 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1875  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 501 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2402  ATP-binding region, ATPase-like  27.45 
 
 		 762 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0299776 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3424  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 758 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0211  sensor histidine kinase  30.3 
 
 		 506 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0352661  normal  0.776224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5435  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 737 aa  109  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.72924  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 758 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3195  histidine kinase  30.24 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107163  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0137  histidine kinase  27.9 
 
 		 391 aa  109  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00141334  normal  0.983928 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 761 aa  108  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3211  bacteriophytochrome-like protein  28.98 
 
 		 842 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.880007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.31 
 
 		 628 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2179  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 710 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.312055 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3789  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 828 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.725659  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4114  histidine kinase  27.95 
 
 		 268 aa  107  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0596823  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1675  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 558 aa  106  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0567929 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0830  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 394 aa  106  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00410023  normal  0.375315 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 1669 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4420  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 922 aa  105  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0348998  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0262  bacteriophytochrome-like protein  27.34 
 
 		 505 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.268371 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0678  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 		 721 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.146546  normal  0.0234435 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 1252 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.758591 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0667  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 929 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3860  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.52 
 
 		 520 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3954  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 792 aa  104  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2049  histidine kinase  27.5 
 
 		 494 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 		 409 aa  103  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5844  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  28.24 
 
 		 529 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.533062 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3091  sensor histidine kinase  29.74 
 
 		 444 aa  103  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5080  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 677 aa  103  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 626 aa  103  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1028  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.8 
 
 		 1248 aa  102  9e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.507304 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3001  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 499 aa  102  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0123  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 506 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489937  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0795  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 911 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.403179  normal  0.168088 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1954  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  23.32 
 
 		 468 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 798 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.505413  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 915 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1760  histidine kinase  26.85 
 
 		 563 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 1140 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3917  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 683 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.465717 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1531  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 607 aa  101  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 607 aa  101  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0233222  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2607  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 		 1144 aa  101  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3338  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 526 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00782598 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 607 aa  101  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 1807 aa  101  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.869779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4414  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 1166 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.107711 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 1195 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1637  sensor histidine kinase  32.57 
 
 		 656 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0556277  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1663  sensor for ctr capsule biosynthesis, histidine kinase acting on RcsB  28.68 
 
 		 1093 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.749752  normal  0.503363 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0038  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.4 
 
 		 1043 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11404 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0317  sensor histidine kinase  29.88 
 
 		 737 aa  100  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.824856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 		 681 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 761 aa  100  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3202  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 		 896 aa  100  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1007  sensory box histidine kinase  29.83 
 
 		 812 aa  100  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22960  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  25.41 
 
 		 552 aa  99.8  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4128  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  34.3 
 
 		 663 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 575 aa  99.4  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4338  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 430 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.743404  decreased coverage  0.000431263 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0021  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.02 
 
 		 668 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  29.68 
 
 		 1133 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 		 435 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.652277 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0019  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.02 
 
 		 668 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1434  sensory box histidine kinase  28.27 
 
 		 821 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0749  sensory box histidine kinase  29.03 
 
 		 597 aa  98.2  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.173426  normal  0.0355967 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 532 aa  98.6  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.030472 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0474  sensory box histidine kinase  28.27 
 
 		 821 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0174  sensory box histidine kinase  28.27 
 
 		 821 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0991  histidine kinase  25.35 
 
 		 462 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 828 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.419482 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3160  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 		 389 aa  97.4  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4119  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 380 aa  97.4  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 604 aa  97.4  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 960 aa  97.8  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1934  two-component sensor kinase protein  28.27 
 
 		 723 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2882  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.44 
 
 		 528 aa  97.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1796  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 		 756 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.232536 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0908  sensory box histidine kinase  28.27 
 
 		 723 aa  97.4  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0382  sensory box histidine kinase  28.27 
 
 		 723 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1844  sensory box histidine kinase  28.27 
 
 		 723 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2154  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 		 572 aa  97.4  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.32555 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1642  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.905013  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2571  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.156881 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1725  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 		 407 aa  97.1  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>