More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1760 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1602  histidine kinase  76.52 
 
 		 582 aa  816    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2867  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  77.65 
 
 		 591 aa  823    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1760  histidine kinase  100 
 
 		 563 aa  1117    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.86 
 
 		 539 aa  452  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.128925  normal  0.0899176 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.94 
 
 		 547 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.817663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2319  putative periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.57 
 
 		 536 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2531  sensory box histidine kinase  38.6 
 
 		 1053 aa  192  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.606569  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1548  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 		 430 aa  191  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.758672 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 		 854 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0053  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 444 aa  178  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1667  histidine kinase  38.83 
 
 		 537 aa  177  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0824698 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0051  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 		 651 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0300  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 		 887 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328128  normal  0.0126688 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0666  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 618 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 506 aa  166  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 		 479 aa  164  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0408317  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5416  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 632 aa  160  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  36.23 
 
 		 749 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1003  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 751 aa  157  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.972748  hitchhiker  0.000165551 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 483 aa  156  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0404114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 		 632 aa  156  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 656 aa  155  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3631  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 361 aa  155  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.991332  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4875  PAS sensor protein  39.6 
 
 		 632 aa  155  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3146  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 		 521 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0539  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 		 751 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.802089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1141  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 		 520 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2077  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein (sensor for arcA)  34.87 
 
 		 492 aa  154  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0651522  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 510 aa  153  7e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54369  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 510 aa  153  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.475252  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4414  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 1166 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.107711 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 510 aa  152  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2567  two component sensor histidine kinase  31.49 
 
 		 526 aa  151  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1212  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 458 aa  151  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.377857  hitchhiker  0.00290095 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 738 aa  150  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4352  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 1166 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4270  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 751 aa  150  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.235212 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2335  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 504 aa  150  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 810 aa  150  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0852026  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 604 aa  150  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2567  sensor histidine kinase  34.59 
 
 		 583 aa  149  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 762 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15596  normal  0.128973 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 748 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5954  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 499 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0760832 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 510 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2356  phytochrome family protein, putative  36.4 
 
 		 755 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.634458 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1116  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  27.36 
 
 		 496 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04304  two-component system sensor protein  31.88 
 
 		 603 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2086  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 798 aa  148  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0947899999999999e-22 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2190  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 		 532 aa  148  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3435  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 605 aa  147  5e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.188279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1956  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 748 aa  147  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727974  normal  0.121547 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 		 604 aa  147  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1827  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 493 aa  147  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 591 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.76 
 
 		 627 aa  146  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0500  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 366 aa  146  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 		 712 aa  145  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0547872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1796  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 756 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.232536 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0666  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 579 aa  144  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.74861  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 704 aa  144  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352611  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 502 aa  144  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1754  bacteriophytochrome  29 
 
 		 538 aa  144  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.478191  normal  0.160792 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2639  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 396 aa  144  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.717158 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.74 
 
 		 553 aa  144  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3012  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 556 aa  144  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0214699  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 915 aa  143  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 		 517 aa  143  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 		 628 aa  143  9e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 1267 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0291  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 543 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.808463 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 761 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22960  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  31.99 
 
 		 552 aa  141  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2988  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 519 aa  141  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21573  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0731  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 536 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000138137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 396 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 1669 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2288  sensor histidine kinase  31.48 
 
 		 520 aa  140  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0097  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 1224 aa  140  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0314  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 583 aa  140  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 		 791 aa  140  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0475  sensory box histidine kinase  35.53 
 
 		 622 aa  140  8.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2669  sensor histidine kinase  34.41 
 
 		 343 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3357  sensory box histidine kinase  35.41 
 
 		 794 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 527 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.521326 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2870  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 		 510 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267269  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5134  histidine kinase  36.07 
 
 		 431 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139793 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5638  histidine kinase  34.67 
 
 		 540 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 1177 aa  139  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2733  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 527 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.219338  normal  0.282473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 527 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151228  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4154  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 493 aa  139  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0881  sensor histidine kinase  32.5 
 
 		 524 aa  139  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525652  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2762  histidine kinase  34.45 
 
 		 558 aa  138  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3485  histidine kinase  28.24 
 
 		 565 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 778 aa  139  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.260825 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0667  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 929 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0806  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 865 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.613384  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 941 aa  138  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.109629  normal  0.20707 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1125  histidine kinase  31.55 
 
 		 564 aa  137  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>