More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3001 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3001  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
499 aa  1019    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 
786 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2879  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 
819 aa  127  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000152143 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3548  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 
486 aa  123  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5080  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 
677 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  23.84 
 
 
1135 aa  118  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 
628 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0555  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 
416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.564143 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2299  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
670 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465317  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.74 
 
 
904 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
821 aa  114  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 
1195 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1315  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 
365 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2081  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 
396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.281834 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.75 
 
 
798 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2990  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 
1253 aa  110  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450084  normal  0.707823 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3091  sensor histidine kinase  28.57 
 
 
444 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0317  sensor histidine kinase  24.56 
 
 
737 aa  108  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.824856  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3425  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 
775 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0531418  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 
761 aa  107  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.85 
 
 
817 aa  107  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1092  aerobic respiration sensor-response protein; histidine protein kinase  30.73 
 
 
584 aa  107  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.962322  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3454  histidine kinase  29.57 
 
 
439 aa  107  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0351684 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2531  sensory box histidine kinase  27.82 
 
 
1053 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.606569  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.31 
 
 
803 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 
704 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352611  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0300  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 
887 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328128  normal  0.0126688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  23 
 
 
792 aa  104  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5013  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 
591 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 
883 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2392  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
363 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3029  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.62 
 
 
461 aa  104  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20083  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1193  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27 
 
 
857 aa  103  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146062  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
627 aa  103  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.99 
 
 
838 aa  103  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0735  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 
396 aa  103  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0103  sensor histidine kinase  30.77 
 
 
379 aa  103  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.689061  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1656  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 
478 aa  103  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.999121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2684  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 
506 aa  103  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546822  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0693  sensory box histidine kinase  26.21 
 
 
602 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.958566  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1956  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 
477 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
1003 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2606  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
664 aa  101  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.383776  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4451  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
775 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0223  sensor histidine kinase  30.91 
 
 
655 aa  101  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.142406  normal  0.0289163 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2607  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
1144 aa  101  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
807 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.309689  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
770 aa  101  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 
779 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689927  normal  0.970382 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3299  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 
757 aa  100  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 
1029 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645634  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1810  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
488 aa  100  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.081179 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.32 
 
 
799 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190357  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
941 aa  100  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.109629  normal  0.20707 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
532 aa  100  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.030472 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 
713 aa  100  8e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.908922  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0678  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
721 aa  99.8  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.146546  normal  0.0234435 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.21 
 
 
796 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1994  histidine kinase  33.64 
 
 
387 aa  99.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.376445  hitchhiker  0.00440814 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1783  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 
494 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.992798  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
1177 aa  99.8  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11543  sensory transduction histidine kinase  30.05 
 
 
952 aa  99.8  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.166055  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1083  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
973 aa  98.6  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1531  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 
643 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2882  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 
528 aa  99  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 
810 aa  99  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0852026  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3211  bacteriophytochrome-like protein  27.78 
 
 
842 aa  98.6  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.880007  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 
1140 aa  98.6  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1125  histidine kinase  31.76 
 
 
564 aa  99  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1341  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
495 aa  99.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0234409  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1953  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
632 aa  98.2  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4875  PAS sensor protein  31.64 
 
 
632 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152822  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
642 aa  98.2  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 
551 aa  98.2  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4414  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.33 
 
 
1166 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.107711 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0394  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
531 aa  97.8  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0150  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
494 aa  97.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1141  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 
520 aa  97.4  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4048  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
431 aa  97.4  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 
712 aa  97.4  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0547872  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3012  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
556 aa  97.1  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0214699  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.57 
 
 
767 aa  97.4  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.87 
 
 
1516 aa  97.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3195  histidine kinase  31.51 
 
 
354 aa  97.1  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107163  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2154  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 
572 aa  96.7  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.32555 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2263  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
632 aa  96.7  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2953  putative PAS/PAC sensor protein  34.84 
 
 
549 aa  96.3  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3146  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 
521 aa  96.3  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2086  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
798 aa  96.3  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0947899999999999e-22 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2403  ATP-binding region, ATPase-like  27.92 
 
 
776 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0308443 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.79 
 
 
891 aa  96.3  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00177504  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
737 aa  96.3  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.224344 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2062  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 
951 aa  96.3  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.275424  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.3 
 
 
812 aa  96.3  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0338  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.57 
 
 
568 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127973  decreased coverage  0.00024777 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3363  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 
515 aa  95.9  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4338  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 
430 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.743404  decreased coverage  0.000431263 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0970  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
729 aa  95.1  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 
639 aa  94.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
1383 aa  95.1  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>