More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1531 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
607 aa  1230    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1531  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
607 aa  1230    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
607 aa  1230    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0233222  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  60.82 
 
 
713 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.908922  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1810  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.23 
 
 
488 aa  260  4e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.081179 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.02 
 
 
704 aa  251  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352611  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.67 
 
 
712 aa  246  8e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0547872  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.41 
 
 
761 aa  236  6e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2132  bacteriophytochrome-like protein  50.62 
 
 
727 aa  217  4e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.205555  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2450  PAS sensor signal transduction histidine kinase  48.93 
 
 
499 aa  217  5e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1953  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.1 
 
 
632 aa  212  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2263  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.88 
 
 
632 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0555  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.88 
 
 
416 aa  206  7e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.564143 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.78 
 
 
960 aa  194  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0201203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2727  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.2 
 
 
576 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.01 
 
 
687 aa  172  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 
1267 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
515 aa  151  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183815  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1289  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
662 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5416  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 
632 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3211  bacteriophytochrome-like protein  32.64 
 
 
842 aa  146  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.880007  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1003  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 
751 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.972748  hitchhiker  0.000165551 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
368 aa  145  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2774  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
535 aa  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 
566 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
1252 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.758591 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2639  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.717158 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2179  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
710 aa  142  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.312055 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0713  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
639 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 
779 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689927  normal  0.970382 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2667  sensory box histidine kinase  38.19 
 
 
498 aa  141  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4875  PAS sensor protein  35.29 
 
 
632 aa  141  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152822  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
632 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
738 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3432  histidine kinase  35.27 
 
 
796 aa  140  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0053  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
444 aa  140  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2790  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 
463 aa  139  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1007  sensory box histidine kinase  37.7 
 
 
812 aa  140  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 
683 aa  139  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2077  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein (sensor for arcA)  33.62 
 
 
492 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0651522  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2154  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 
572 aa  139  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.32555 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
627 aa  139  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
883 aa  138  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1043  sensory box histidine kinase  33.1 
 
 
767 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.382651  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 
546 aa  138  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0908  sensory box histidine kinase  37.3 
 
 
723 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0382  sensory box histidine kinase  37.3 
 
 
723 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1934  two-component sensor kinase protein  37.3 
 
 
723 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0474  sensory box histidine kinase  37.3 
 
 
821 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4276  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
779 aa  137  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0174  sensory box histidine kinase  37.3 
 
 
821 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1434  sensory box histidine kinase  37.3 
 
 
821 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
532 aa  138  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.030472 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1193  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 
857 aa  137  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146062  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5034  histidine kinase  34.36 
 
 
498 aa  137  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1844  sensory box histidine kinase  37.3 
 
 
723 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2867  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.52 
 
 
591 aa  137  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 
380 aa  137  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1145  multi-sensor signal transduction multi-kinase  33.85 
 
 
532 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0051  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 
651 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
502 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36757  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 
760 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 
656 aa  137  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4111  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 
760 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2049  histidine kinase  35.8 
 
 
494 aa  137  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 
486 aa  136  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0161289 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0300  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 
887 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328128  normal  0.0126688 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2531  sensory box histidine kinase  36.19 
 
 
1053 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.606569  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 
769 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1602  histidine kinase  32.82 
 
 
582 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3852  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
765 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1148  sensor histidine kinase  33.6 
 
 
604 aa  135  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0667  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 
929 aa  135  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3357  sensory box histidine kinase  35.29 
 
 
794 aa  135  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1994  histidine kinase  34.6 
 
 
387 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.376445  hitchhiker  0.00440814 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4451  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 
775 aa  135  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 
1003 aa  135  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8461  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  34.68 
 
 
528 aa  134  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3455  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 
472 aa  134  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0316  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
713 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810499  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11543  sensory transduction histidine kinase  31.25 
 
 
952 aa  133  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.166055  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0970  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 
729 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 
1140 aa  132  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2998  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 
391 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2818  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
769 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0945314 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
591 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 
355 aa  131  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0285  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 
713 aa  132  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5844  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  32.53 
 
 
529 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.533062 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
396 aa  131  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 
1532 aa  130  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22960  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  32.38 
 
 
552 aa  130  7.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1548  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
430 aa  130  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.758672 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1760  histidine kinase  32.27 
 
 
563 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2388  sensory box histidine kinase  33.33 
 
 
733 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1212  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 
458 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.377857  hitchhiker  0.00290095 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 
517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
604 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 
626 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
770 aa  129  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>