More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3029 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3029  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 461 aa  933    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2879  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 819 aa  223  8e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000152143 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0317  sensor histidine kinase  37.46 
 
 		 737 aa  219  6e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.824856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3091  sensor histidine kinase  40.77 
 
 		 444 aa  189  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1092  aerobic respiration sensor-response protein; histidine protein kinase  40.91 
 
 		 584 aa  172  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.962322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1315  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 		 365 aa  170  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.57 
 
 		 628 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2392  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 363 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3454  histidine kinase  39.21 
 
 		 439 aa  160  4e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0351684 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2081  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 396 aa  155  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.281834 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1956  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 477 aa  154  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1525  ATP-binding region ATPase domain protein  36.36 
 
 		 359 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.636632 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0543  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 717 aa  133  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1222  signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 		 650 aa  133  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.495402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 		 712 aa  133  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0547872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3487  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 717 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1141  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 		 520 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3211  bacteriophytochrome-like protein  26.14 
 
 		 842 aa  131  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.880007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2077  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein (sensor for arcA)  30.03 
 
 		 492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0651522  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.2 
 
 		 553 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0542  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 719 aa  127  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.06 
 
 		 770 aa  126  8.000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.7 
 
 		 941 aa  125  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.109629  normal  0.20707 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3468  sensor histidine kinase  36.16 
 
 		 651 aa  124  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 717 aa  123  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2577  sensor histidine kinase  28.74 
 
 		 349 aa  123  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.75 
 
 		 1064 aa  123  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0693  sensory box histidine kinase  23.79 
 
 		 602 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.958566  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0051  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 651 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0211  sensor histidine kinase  28.28 
 
 		 506 aa  121  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0352661  normal  0.776224 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3766  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 		 717 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 		 717 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.15 
 
 		 510 aa  120  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1419  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.95 
 
 		 831 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3146  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.15 
 
 		 521 aa  120  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3948  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 		 717 aa  120  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0223  sensor histidine kinase  33.19 
 
 		 655 aa  120  7e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.142406  normal  0.0289163 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1193  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 		 857 aa  119  7.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3822  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 		 717 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.834811  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.08 
 
 		 634 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 704 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352611  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2100  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.87 
 
 		 637 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.269626 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0731  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.81 
 
 		 536 aa  117  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000138137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2907  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.39 
 
 		 520 aa  116  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0544  sensory box histidine kinase  27.52 
 
 		 717 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.55 
 
 		 1669 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2057  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 		 352 aa  114  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.566261 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0288  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.58 
 
 		 884 aa  114  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 761 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 		 384 aa  113  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00811703  normal  0.288098 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.06 
 
 		 973 aa  113  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3605  ATP-binding region, ATPase-like protein  26.25 
 
 		 873 aa  113  9e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0038  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 1043 aa  113  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11404 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2531  sensory box histidine kinase  27.62 
 
 		 1053 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.606569  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2837  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 		 716 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2607  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 1144 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7206  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.06 
 
 		 1499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2388  sensory box histidine kinase  24.68 
 
 		 733 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1810  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.13 
 
 		 488 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.081179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5416  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 632 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.67 
 
 		 1237 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2990  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 1253 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450084  normal  0.707823 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2401  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.9 
 
 		 991 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1289  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.88 
 
 		 662 aa  111  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.89 
 
 		 1195 aa  111  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0675  aerobic respiration sensor-response protein; histidine protein kinase  32.73 
 
 		 646 aa  111  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.779748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.98 
 
 		 639 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 		 373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2450  PAS sensor signal transduction histidine kinase  24.8 
 
 		 499 aa  110  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1148  sensor histidine kinase  30.71 
 
 		 604 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4377  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 636 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.89 
 
 		 484 aa  109  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0166  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 		 602 aa  109  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2794  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 767 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.470571 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3437  sensory box histidine kinase  30.33 
 
 		 533 aa  108  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.33 
 
 		 883 aa  108  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.27 
 
 		 1363 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 1807 aa  108  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.869779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2154  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 572 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.32555 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 		 517 aa  108  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2540  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 809 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1862  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.61 
 
 		 869 aa  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.557725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 587 aa  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0344  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 		 730 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0059666  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2179  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.24 
 
 		 710 aa  107  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.312055 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 732 aa  107  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.16722  normal  0.0140597 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 		 568 aa  107  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2845  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.81 
 
 		 545 aa  107  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000115656  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5079  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.27 
 
 		 695 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.929766 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0255  sensory box histidine kinase  25.1 
 
 		 616 aa  106  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 		 1255 aa  107  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  25.14 
 
 		 1348 aa  106  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.95 
 
 		 1578 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0667  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 929 aa  106  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0009  sensory box histidine kinase  29.83 
 
 		 499 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3357  sensory box histidine kinase  25.06 
 
 		 794 aa  106  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1756  PAS sensor signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 		 718 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.977279  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3163  sensory box histidine kinase  26.65 
 
 		 683 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.4 
 
 		 1611 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.66 
 
 		 575 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>