More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3510 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3510  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 521 aa  1056    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.269968 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 		 498 aa  306  8.000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1725  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 499 aa  253  4.0000000000000004e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 517 aa  232  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 502 aa  227  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4326  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.37 
 
 		 571 aa  222  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 		 656 aa  221  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0428  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.86 
 
 		 455 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0344  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 730 aa  209  8e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0059666  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4276  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 779 aa  209  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 		 738 aa  207  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0439  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.69 
 
 		 455 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.444664 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.93 
 
 		 953 aa  204  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 778 aa  203  5e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.260825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.38 
 
 		 426 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2117  putative PAS/PAC sensor protein  39.92 
 
 		 257 aa  201  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1756  PAS sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 718 aa  200  6e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.977279  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1286  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 859 aa  199  9e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3146  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 521 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3435  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 605 aa  196  8.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.188279 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1141  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.66 
 
 		 520 aa  194  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0009  sensory box histidine kinase  41.67 
 
 		 499 aa  194  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 714 aa  193  8e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.523166 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 1177 aa  191  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 		 604 aa  190  7e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.7 
 
 		 989 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1814  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.2 
 
 		 566 aa  189  9e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267062 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 		 483 aa  189  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0404114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 572 aa  189  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 989 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3160  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 389 aa  188  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2639  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.74 
 
 		 396 aa  188  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.717158 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 1140 aa  188  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3357  sensory box histidine kinase  34.78 
 
 		 794 aa  187  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5638  histidine kinase  40.84 
 
 		 540 aa  187  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2077  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein (sensor for arcA)  27.86 
 
 		 492 aa  187  6e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0651522  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 775 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3012  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 556 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0214699  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2669  sensor histidine kinase  40.94 
 
 		 343 aa  183  6e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04304  two-component system sensor protein  32.99 
 
 		 603 aa  182  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1116  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  41.74 
 
 		 496 aa  182  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 1354 aa  182  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2845  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 545 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000115656  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0666  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 618 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  36.43 
 
 		 749 aa  180  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2990  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 		 1253 aa  181  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450084  normal  0.707823 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 		 628 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.92 
 
 		 1003 aa  180  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 904 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 		 810 aa  178  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0852026  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 396 aa  178  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2086  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 798 aa  177  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0947899999999999e-22 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4824  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 		 431 aa  177  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2988  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 519 aa  177  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21573  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.45 
 
 		 762 aa  176  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15596  normal  0.128973 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3437  sensory box histidine kinase  41.45 
 
 		 533 aa  176  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2667  sensory box histidine kinase  32.36 
 
 		 498 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 915 aa  176  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2853  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 578 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0731  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 536 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000138137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4377  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 636 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2567  sensor histidine kinase  40.76 
 
 		 583 aa  173  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 		 807 aa  173  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.309689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2770  histidine kinase  39.92 
 
 		 418 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1796  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.81 
 
 		 756 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.232536 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  35.51 
 
 		 429 aa  173  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0883  response regulator receiver  36.4 
 
 		 273 aa  173  6.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4047  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.73 
 
 		 431 aa  173  9e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 1267 aa  172  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 		 479 aa  172  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0408317  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0539  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 		 751 aa  172  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.802089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0103  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.16 
 
 		 639 aa  172  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2789  sensory box histidine kinase  37.98 
 
 		 770 aa  171  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1827  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 		 493 aa  171  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 1562 aa  171  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.94 
 
 		 553 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2356  phytochrome family protein, putative  42.86 
 
 		 755 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.634458 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0541  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 587 aa  171  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000947824  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.54 
 
 		 517 aa  171  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1148  sensor histidine kinase  42.26 
 
 		 604 aa  170  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5013  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 591 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2565  sensor histidine kinase  39.22 
 
 		 255 aa  170  6e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 		 355 aa  170  7e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 510 aa  170  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  36.78 
 
 		 404 aa  169  8e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 		 748 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 		 368 aa  169  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2088  histidine kinase  42.29 
 
 		 282 aa  169  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.409720000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2742  sensory box histidine kinase  41.67 
 
 		 363 aa  169  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.507187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0097  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.16 
 
 		 1224 aa  169  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3669  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.54 
 
 		 432 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4048  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 431 aa  168  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 		 591 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2567  two component sensor histidine kinase  39.77 
 
 		 526 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0713  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 639 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0749  sensory box histidine kinase  38.01 
 
 		 597 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.173426  normal  0.0355967 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.41 
 
 		 604 aa  167  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.49 
 
 		 791 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1121  histidine kinase  39.36 
 
 		 307 aa  167  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3327  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 578 aa  167  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>