More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0201 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0201  iron dependent repressor  100 
 
 
715 aa  1477    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.132112  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2466  putative PAS/PAC sensor protein  36.9 
 
 
558 aa  280  5e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0984  putative PAS/PAC sensor protein  37.97 
 
 
445 aa  172  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0111157  normal  0.198492 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2430  putative PAS/PAC sensor protein  28.84 
 
 
821 aa  165  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 
535 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0220  putative PAS/PAC sensor protein  31.11 
 
 
432 aa  154  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1057  putative PAS/PAC sensor protein  35.62 
 
 
449 aa  145  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0334247  normal  0.158346 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0333  putative PAS/PAC sensor protein  28.61 
 
 
477 aa  139  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.522963  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2750  putative PAS/PAC sensor protein  28.62 
 
 
883 aa  138  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2741  putative PAS/PAC sensor protein  27.45 
 
 
490 aa  126  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2875  putative PAS/PAC sensor protein  29.11 
 
 
707 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.510483  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0770  putative PAS/PAC sensor protein  27.25 
 
 
439 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0798004  normal  0.2382 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 
559 aa  118  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0782  putative PAS/PAC sensor protein  26.84 
 
 
468 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102287  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2272  putative PAS/PAC sensor protein  26.03 
 
 
925 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2016  putative PAS/PAC sensor protein  34.01 
 
 
589 aa  114  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.115165 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1706  putative PAS/PAC sensor protein  25.19 
 
 
605 aa  105  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 
1741 aa  105  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1136  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
608 aa  104  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2997  putative PAS/PAC sensor protein  26.99 
 
 
423 aa  104  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1071  hypothetical protein  36.52 
 
 
160 aa  102  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0728316  normal  0.146966 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 
953 aa  101  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2475  putative PAS/PAC sensor protein  29.17 
 
 
626 aa  100  8e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.732483  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1101  putative PAS/PAC sensor protein  26.02 
 
 
690 aa  99.8  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.770779  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  32.86 
 
 
1062 aa  96.3  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0186  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.15 
 
 
740 aa  94.4  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.789311  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1421  putative PAS/PAC sensor protein  22.9 
 
 
588 aa  94  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0454368  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1722  putative PAS/PAC sensor protein  26.29 
 
 
479 aa  92.8  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  29.46 
 
 
1061 aa  90.9  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2108  multisensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 
492 aa  90.5  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  25.89 
 
 
1390 aa  90.5  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1412  putative PAS/PAC sensor protein  27.2 
 
 
596 aa  89  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.144483  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 
466 aa  88.6  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3868  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.06 
 
 
1021 aa  86.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1398  putative PAS/PAC sensor protein  23.86 
 
 
451 aa  85.9  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.23 
 
 
1148 aa  85.1  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 
638 aa  85.1  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.679676  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25.36 
 
 
843 aa  84.3  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0011  putative PAS/PAC sensor protein  32.95 
 
 
969 aa  84  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161167  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
462 aa  84  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  24.25 
 
 
1177 aa  83.2  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2092  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 
841 aa  82.4  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0705515  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 
1039 aa  82.8  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
807 aa  82.4  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.672924  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 
1426 aa  81.3  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2764  putative PAS/PAC sensor protein  26.02 
 
 
593 aa  80.5  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.359165  normal  0.516163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.42 
 
 
524 aa  80.1  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0005  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.77 
 
 
1399 aa  79.7  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7049  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1166  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 
507 aa  79.3  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1348  putative PAS/PAC sensor protein  28.76 
 
 
888 aa  79  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2414  multisensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 
505 aa  78.6  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.40518  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0273  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  24.12 
 
 
1078 aa  77.4  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1528  hypothetical protein  31.95 
 
 
200 aa  75.5  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000210266  normal  0.0656807 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0967  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.75 
 
 
1004 aa  75.1  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1010  signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
626 aa  74.3  0.000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0006  putative PAS/PAC sensor protein  26.62 
 
 
412 aa  73.9  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.533638  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1260  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.63 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 
3706 aa  73.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 
909 aa  73.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.61 
 
 
1266 aa  72.4  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 
655 aa  71.2  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1775  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.92 
 
 
510 aa  71.2  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  29.03 
 
 
1289 aa  70.9  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1003  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32 
 
 
538 aa  70.9  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  22.43 
 
 
1112 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2710  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.57 
 
 
585 aa  70.1  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.132036  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 
652 aa  70.5  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  29.24 
 
 
754 aa  69.7  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.56 
 
 
962 aa  69.3  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.44 
 
 
1791 aa  68.9  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
801 aa  69.3  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1750  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  35.04 
 
 
896 aa  68.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.42554 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1041  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.16 
 
 
1406 aa  68.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.845277 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1026  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 
599 aa  67.8  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0934785  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1767  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.92 
 
 
1157 aa  67.4  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.03 
 
 
1051 aa  67.4  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 
1069 aa  67  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
813 aa  67  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  23.96 
 
 
886 aa  66.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3113  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 
962 aa  66.6  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  24.31 
 
 
2693 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.22 
 
 
761 aa  66.6  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1158  putative PAS/PAC sensor protein  29.2 
 
 
753 aa  65.5  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3741  putative PAS/PAC sensor protein  27.16 
 
 
1268 aa  65.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 
1111 aa  65.1  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.7 
 
 
844 aa  65.5  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0825  response regulator receiver  33.78 
 
 
204 aa  63.9  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1918  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.83 
 
 
878 aa  63.9  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.32 
 
 
810 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  22.98 
 
 
853 aa  63.9  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0531  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.75 
 
 
1193 aa  63.9  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.17 
 
 
873 aa  63.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 
968 aa  63.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1945  putative PAS/PAC sensor protein  36.51 
 
 
676 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  24.62 
 
 
1676 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  20.99 
 
 
1043 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0093  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 
856 aa  63.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.83 
 
 
1131 aa  62.4  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  26.56 
 
 
1226 aa  62.4  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1676  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 
850 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>