More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2222 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2222  histidine kinase  100 
 
 		 605 aa  1233    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0226681 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 		 625 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.48 
 
 		 628 aa  396  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 		 629 aa  375  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1963  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 		 642 aa  204  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.743491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.32 
 
 		 466 aa  203  9e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0821  putative PAS/PAC sensor protein  34.9 
 
 		 715 aa  187  5e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.99772  normal  0.688187 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.89 
 
 		 800 aa  183  8.000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 781 aa  183  8.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0157  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.69 
 
 		 1329 aa  183  9.000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0324  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.69 
 
 		 464 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1707  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 		 535 aa  177  5e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.366818  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.53 
 
 		 543 aa  177  7e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.624689  normal  0.503479 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 659 aa  176  8e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.12 
 
 		 903 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.644945  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.39 
 
 		 593 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.2 
 
 		 793 aa  172  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.73474  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0884  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.89 
 
 		 807 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00331872  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1136  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 		 608 aa  161  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 		 735 aa  160  4e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  31.25 
 
 		 631 aa  160  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0519  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 		 531 aa  160  7e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1528  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.33 
 
 		 659 aa  158  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2876  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 930 aa  156  8e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1464  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.09 
 
 		 579 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 		 576 aa  154  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2205  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 		 466 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 592 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1777  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 		 477 aa  134  6.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2092  putative PAS/PAC sensor protein  25.5 
 
 		 628 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.180005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5449  histidine kinase  26.6 
 
 		 542 aa  96.3  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116317  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2049  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 711 aa  95.9  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1828  sensor histidine kinase  27.08 
 
 		 674 aa  90.9  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.719935  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1433  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.28 
 
 		 974 aa  90.5  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717996  normal  0.840517 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2168  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 711 aa  89.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1497  diguanylate cyclase  25.5 
 
 		 510 aa  89  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000624142  hitchhiker  0.000000668265 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2114  ATP-binding region ATPase domain protein  25.59 
 
 		 400 aa  87  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.673781 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1116  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  28.77 
 
 		 496 aa  87  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4154  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 493 aa  87.4  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  27.33 
 
 		 777 aa  86.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0666  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 618 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3584  histidine kinase  24.8 
 
 		 495 aa  86.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0038  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 1043 aa  86.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11404 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1500  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 590 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3854  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  27.56 
 
 		 484 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1156  sensor protein KdpD  27.27 
 
 		 908 aa  84.3  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.486498  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1103  sensor protein KdpD  27.27 
 
 		 908 aa  84.3  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0538967  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2352  histidine kinase  29.72 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1922  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 		 558 aa  84.3  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1148  sensor histidine kinase  26.73 
 
 		 604 aa  84  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.16 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03078  sensor histidine kinase  29.59 
 
 		 678 aa  84  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2667  sensory box histidine kinase  29.17 
 
 		 498 aa  83.6  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 578 aa  82.8  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1996  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 		 584 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0327436  normal  0.170409 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1253  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 584 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1245  sensor protein KdpD  28.22 
 
 		 897 aa  82.4  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.011545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1997  histidine kinase/response regulator hybrid protein  29.06 
 
 		 558 aa  82  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.947527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 480 aa  82  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0142  histidine kinase  30.22 
 
 		 614 aa  82  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3579  sensor protein KdpD  26.82 
 
 		 908 aa  82  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0262  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 523 aa  81.6  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1029  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 474 aa  81.3  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2403  ATP-binding region, ATPase-like  28.57 
 
 		 776 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0308443 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1215  sensor protein KdpD  27.06 
 
 		 915 aa  80.9  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.693772  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  41.28 
 
 		 617 aa  80.9  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4693  histidine kinase  26.48 
 
 		 561 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 		 606 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1674  histidine kinase  26.04 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  26.62 
 
 		 484 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  26.45 
 
 		 484 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3202  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 896 aa  80.5  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  26.45 
 
 		 484 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1902  bacteriophytochrome histidine kinase  28.46 
 
 		 745 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333534  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  26.45 
 
 		 484 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 361 aa  80.1  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.121387  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3161  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 		 437 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05220  diguanylate cyclase  26.04 
 
 		 501 aa  80.1  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3287  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 584 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.847642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 813 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1125  histidine kinase  24.67 
 
 		 564 aa  79  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1522  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.87 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3664  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 		 708 aa  79.3  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1495  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.87 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2230  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.49 
 
 		 707 aa  78.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0764  sensor protein KdpD  29.41 
 
 		 894 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2162  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 745 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.894867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2070  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.57 
 
 		 613 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0291  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.18 
 
 		 543 aa  78.6  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.808463 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0811  sensor protein KdpD  29.41 
 
 		 894 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00623216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0825  sensor protein KdpD  29.41 
 
 		 894 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0325382 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0861  sensor protein KdpD  28.95 
 
 		 905 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 479 aa  78.2  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0408317  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2991  sensor histidine kinase  27.65 
 
 		 677 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.676986  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  27.94 
 
 		 1053 aa  78.2  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3177  sensory histidine kinase CreC  27.09 
 
 		 474 aa  78.2  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.210044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1127  sensor protein KdpD  27.13 
 
 		 910 aa  78.2  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0751  sensor protein KdpD  29.41 
 
 		 894 aa  78.2  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>