More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3664 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012030  Hlac_3664  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
708 aa  1426    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3655  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.16 
 
 
858 aa  276  1.0000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 
991 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 
511 aa  229  2e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0103276  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2051  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 
748 aa  203  9.999999999999999e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.167205 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1800  histidine kinase  42.04 
 
 
588 aa  186  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2352  histidine kinase  44.92 
 
 
387 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0059  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.02 
 
 
729 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318391  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.56 
 
 
426 aa  180  8e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.525056  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
578 aa  167  9e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
483 aa  164  5.0000000000000005e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
735 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
473 aa  146  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.753978 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.29 
 
 
689 aa  145  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3883  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.09 
 
 
882 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0606  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 
785 aa  139  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0856  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.54 
 
 
893 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1643  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.36 
 
 
739 aa  136  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 
626 aa  135  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
1064 aa  131  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2186  histidine kinase  36.92 
 
 
383 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0452975  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0519  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 
531 aa  126  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1104  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 
569 aa  124  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53532  normal  0.324425 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 
641 aa  124  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
789 aa  123  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.179581  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.68 
 
 
841 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.05 
 
 
1501 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
516 aa  121  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.93 
 
 
1064 aa  118  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0183  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 
390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0324  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 
464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0330  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.33 
 
 
531 aa  115  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23 
 
 
1193 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23 
 
 
1193 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 
1055 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 
604 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2385  histidine kinase  32.52 
 
 
337 aa  115  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0667  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.95 
 
 
929 aa  114  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0851  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.88 
 
 
469 aa  114  6e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0355773  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1000  histidine kinase  32.85 
 
 
582 aa  114  8.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798946  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 
761 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.16 
 
 
1118 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 
960 aa  113  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
562 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.121796  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0375  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.92 
 
 
1070 aa  112  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.84 
 
 
1236 aa  112  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.28 
 
 
1611 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  26.75 
 
 
1417 aa  111  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.64 
 
 
1236 aa  111  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 
938 aa  110  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.84 
 
 
1236 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0005  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 
1399 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7049  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.43 
 
 
1478 aa  110  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.07 
 
 
1578 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0981  putative sensor/response regulator hybrid  26.45 
 
 
1418 aa  109  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195382  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  24.22 
 
 
1233 aa  109  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
466 aa  109  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1771  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.45 
 
 
669 aa  108  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.38 
 
 
1234 aa  108  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3567  putative PAS/PAC sensor protein  29.41 
 
 
738 aa  108  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339814  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 
654 aa  107  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0884  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 
807 aa  107  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00331872  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.94 
 
 
1044 aa  107  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  23.97 
 
 
1188 aa  107  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1409  Signal transduction histidine kinase-like  24.62 
 
 
685 aa  107  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.28 
 
 
639 aa  107  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.36 
 
 
659 aa  107  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.47344  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.7 
 
 
1131 aa  106  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 
547 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.05 
 
 
1238 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.05 
 
 
1238 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0390  ligand-binding sensor domain-containing protein  22.38 
 
 
1275 aa  106  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.69 
 
 
1238 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2923  histidine kinase  31.73 
 
 
385 aa  105  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0771674  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 
644 aa  105  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 
3706 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1687  signal-transducing histidine kinase  24.05 
 
 
565 aa  105  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10306  normal  0.175724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3076  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.01 
 
 
616 aa  104  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.315862  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  24.79 
 
 
1236 aa  104  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.15 
 
 
1514 aa  104  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.84 
 
 
1238 aa  104  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.15 
 
 
1514 aa  104  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.32 
 
 
385 aa  103  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.54 
 
 
1121 aa  103  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2120  histidine kinase  31.63 
 
 
384 aa  103  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.238176  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.43 
 
 
1202 aa  103  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.11 
 
 
745 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.705901 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.96 
 
 
1124 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4249  putative PAS/PAC sensor protein  26.18 
 
 
579 aa  102  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1875  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 
501 aa  102  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.27 
 
 
603 aa  102  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.12 
 
 
721 aa  101  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.814379  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2084  sensor for ctr capsule biosynthesis; sensor histidine kinase  22.25 
 
 
660 aa  101  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  24.47 
 
 
2279 aa  100  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.51 
 
 
1034 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.06 
 
 
502 aa  99.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2907  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 
520 aa  99  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
1532 aa  98.6  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.9 
 
 
1138 aa  98.2  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>