More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4260 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 464 aa  911    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.093144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3644  histidine kinase  72.09 
 
 		 460 aa  629  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3342  histidine kinase  71.65 
 
 		 460 aa  621  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0710689 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6107  two component sensor kinase  69.39 
 
 		 467 aa  577  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0311  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.37 
 
 		 476 aa  489  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 		 474 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 		 474 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  40.72 
 
 		 474 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.36 
 
 		 477 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 		 471 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314364  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 		 476 aa  253  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  39.46 
 
 		 472 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  39.36 
 
 		 496 aa  252  9.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  37.85 
 
 		 474 aa  250  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 		 478 aa  251  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 		 463 aa  249  8e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 		 463 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  40.46 
 
 		 504 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  39.91 
 
 		 472 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1126  sensor histidine kinase  41.05 
 
 		 501 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2278  sensor histidine kinase  41.05 
 
 		 501 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992054  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0115  sensor histidine kinase  41.05 
 
 		 501 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0953  sensor histidine kinase  41.05 
 
 		 501 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1038  Signal transduction histidine kinase  41.05 
 
 		 501 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1500  sensor histidine kinase  41.05 
 
 		 501 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 457 aa  233  5e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.933036  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  38.15 
 
 		 506 aa  231  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54500  two-component sensor  37.7 
 
 		 460 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.452392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2766  histidine kinase  40.64 
 
 		 476 aa  230  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0989044  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1355  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 461 aa  229  7e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 459 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 459 aa  226  9e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 		 463 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3964  sensor histidine kinase  36.61 
 
 		 460 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3584  histidine kinase  37.5 
 
 		 495 aa  222  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 459 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  35.09 
 
 		 467 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  35.59 
 
 		 499 aa  219  8.999999999999998e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4637  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.23 
 
 		 485 aa  217  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.337185  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  35.93 
 
 		 460 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  35.22 
 
 		 501 aa  216  9e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3935  two-component regulatory system sensory histidine kinase  33.91 
 
 		 475 aa  216  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 		 479 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292807  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1735  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  38.5 
 
 		 471 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3339  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 		 472 aa  213  4.9999999999999996e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.184807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 462 aa  213  5.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  37.18 
 
 		 439 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 481 aa  211  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3436  sensor histidine kinase  36.95 
 
 		 497 aa  210  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.999938  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 531 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2571  histidine kinase  32.99 
 
 		 489 aa  210  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673908 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  34.17 
 
 		 526 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.85 
 
 		 513 aa  209  8e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  35.74 
 
 		 463 aa  209  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1450  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 460 aa  209  9e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126208  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2866  histidine kinase  36.32 
 
 		 508 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 465 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2936  putative transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  35.76 
 
 		 500 aa  208  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 509 aa  207  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 465 aa  205  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3932  histidine kinase  33.48 
 
 		 474 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3348  histidine kinase  35.79 
 
 		 481 aa  204  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0882915  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 524 aa  204  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3588  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 474 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3998  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 493 aa  204  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  34.14 
 
 		 518 aa  204  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  34.14 
 
 		 523 aa  203  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  33.41 
 
 		 517 aa  202  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  34.08 
 
 		 817 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4037  histidine kinase  34.57 
 
 		 464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1532  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 469 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 469 aa  200  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.248447  normal  0.139653 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 473 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.739946  normal  0.0152706 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.08 
 
 		 515 aa  200  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 515 aa  199  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0728  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 467 aa  199  7e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4039  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 460 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 482 aa  198  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0877  histidine kinase  34.62 
 
 		 500 aa  198  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43922 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3215  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 		 477 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3951  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 		 484 aa  197  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0287  two-component system, sensor protein  33.99 
 
 		 457 aa  197  3e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0258  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 457 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.818246  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  33.7 
 
 		 505 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  33.7 
 
 		 505 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0058  histidine kinase  35.31 
 
 		 461 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  33.48 
 
 		 505 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5324  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 473 aa  196  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 515 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  33.48 
 
 		 505 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1181  sensor histidine kinase  34.83 
 
 		 469 aa  195  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3012  histidine kinase  33.11 
 
 		 473 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250655  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4162  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 476 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 455 aa  195  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1365  histidine kinase  32.68 
 
 		 463 aa  194  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2527  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 473 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.547854 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 519 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1092  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 480 aa  194  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 		 515 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0041  sensor histidine kinase  35.89 
 
 		 459 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>