More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3213 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2936  putative transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  86.6 
 
 		 500 aa  791    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 509 aa  1005    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2866  histidine kinase  98.62 
 
 		 508 aa  986    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3584  histidine kinase  45.73 
 
 		 495 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3436  sensor histidine kinase  45.85 
 
 		 497 aa  355  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.999938  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  38.76 
 
 		 496 aa  277  3e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3333  histidine kinase  42.01 
 
 		 468 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 		 474 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 		 474 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1451  histidine kinase  40.28 
 
 		 440 aa  263  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.495687  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  37.04 
 
 		 472 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  37.97 
 
 		 474 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 		 463 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 		 463 aa  259  9e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2571  histidine kinase  39.48 
 
 		 489 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673908 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  38.06 
 
 		 504 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 		 477 aa  254  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 		 471 aa  254  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314364  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 476 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3803  histidine kinase  35.23 
 
 		 472 aa  245  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.29901  normal  0.450405 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0115  sensor histidine kinase  37.59 
 
 		 501 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1126  sensor histidine kinase  37.59 
 
 		 501 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1500  sensor histidine kinase  37.59 
 
 		 501 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2278  sensor histidine kinase  37.59 
 
 		 501 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992054  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  36.36 
 
 		 439 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0953  sensor histidine kinase  37.59 
 
 		 501 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1038  Signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 		 501 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  35.71 
 
 		 472 aa  243  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  36.71 
 
 		 474 aa  242  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 		 478 aa  242  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3935  two-component regulatory system sensory histidine kinase  35.46 
 
 		 475 aa  239  8e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41148  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  37.47 
 
 		 460 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 462 aa  236  7e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3964  sensor histidine kinase  37.42 
 
 		 460 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  35.06 
 
 		 501 aa  234  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 		 463 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 		 459 aa  233  9e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1355  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 		 461 aa  232  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 517 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 459 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 519 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54500  two-component sensor  37.63 
 
 		 460 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.452392 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 		 515 aa  230  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1532  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 469 aa  230  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  34.61 
 
 		 463 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 485 aa  228  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.701782 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  35.57 
 
 		 467 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 457 aa  228  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.933036  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1365  histidine kinase  35.11 
 
 		 463 aa  228  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  35.86 
 
 		 499 aa  227  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  36.34 
 
 		 517 aa  227  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 515 aa  227  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 459 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 462 aa  225  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  35.52 
 
 		 523 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 479 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1735  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  38.02 
 
 		 471 aa  224  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  35.31 
 
 		 518 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  35.16 
 
 		 817 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  35.39 
 
 		 526 aa  223  9e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 		 524 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2516  histidine kinase  34.71 
 
 		 495 aa  221  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  35.04 
 
 		 505 aa  221  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  35.04 
 
 		 505 aa  221  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 517 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 517 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  35.04 
 
 		 505 aa  219  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3012  histidine kinase  34.53 
 
 		 473 aa  219  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250655  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  36.09 
 
 		 517 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  35.04 
 
 		 505 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2766  histidine kinase  37.55 
 
 		 476 aa  219  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0989044  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.11 
 
 		 513 aa  218  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2579  histidine kinase  34.66 
 
 		 466 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  35.5 
 
 		 517 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 531 aa  217  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 465 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 515 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 		 465 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4039  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 460 aa  213  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.5 
 
 		 515 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 515 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4763  two-component sensor  37.76 
 
 		 460 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42346  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3951  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 484 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3644  histidine kinase  34.45 
 
 		 460 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 479 aa  210  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3282  histidine kinase  34.5 
 
 		 483 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 487 aa  209  8e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3339  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 		 472 aa  209  9e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.184807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0497  histidine kinase  34.87 
 
 		 464 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.623662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  35.58 
 
 		 506 aa  208  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0499  histidine kinase  34.23 
 
 		 518 aa  207  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 481 aa  206  9e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 464 aa  205  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.093144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3342  histidine kinase  34.45 
 
 		 460 aa  206  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0710689 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4037  histidine kinase  35.64 
 
 		 464 aa  206  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0058  histidine kinase  36.63 
 
 		 461 aa  205  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3336  two component sensor kinase  33.87 
 
 		 473 aa  204  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0311  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 476 aa  203  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3215  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 		 477 aa  203  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6107  two component sensor kinase  34.03 
 
 		 467 aa  202  8e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>