More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1232 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  82.39 
 
 
462 aa  717    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113981  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
479 aa  962    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  69.72 
 
 
485 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.701782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3012  histidine kinase  67.32 
 
 
473 aa  608  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250655  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2516  histidine kinase  66.16 
 
 
495 aa  578  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142039  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  67.76 
 
 
467 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135956 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2074  histidine kinase  68.19 
 
 
467 aa  565  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.157607  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2571  histidine kinase  61.89 
 
 
489 aa  554  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673908 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3935  two-component regulatory system sensory histidine kinase  39.02 
 
 
475 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41148  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  39.16 
 
 
496 aa  263  6.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  38.05 
 
 
474 aa  259  8e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.6 
 
 
465 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1355  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 
461 aa  251  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872823  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54500  two-component sensor  40 
 
 
460 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.452392 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3339  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 
472 aa  247  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.184807  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2936  putative transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  35.74 
 
 
500 aa  239  9e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 
459 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 
463 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  35.96 
 
 
472 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 
463 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4763  two-component sensor  39 
 
 
460 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42346  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 
459 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 
463 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 
477 aa  236  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 
459 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 
474 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 
474 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  36.64 
 
 
504 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  35.97 
 
 
474 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1365  histidine kinase  38.07 
 
 
463 aa  230  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 
476 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3436  sensor histidine kinase  36.9 
 
 
497 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.999938  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2579  histidine kinase  36 
 
 
466 aa  228  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  36.19 
 
 
460 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 
471 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3964  sensor histidine kinase  36.34 
 
 
460 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
524 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2866  histidine kinase  36.44 
 
 
508 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3584  histidine kinase  35.8 
 
 
495 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1126  sensor histidine kinase  36.41 
 
 
501 aa  222  9e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0953  sensor histidine kinase  36.41 
 
 
501 aa  222  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2278  sensor histidine kinase  36.41 
 
 
501 aa  222  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992054  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1500  sensor histidine kinase  36.41 
 
 
501 aa  222  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0115  sensor histidine kinase  36.41 
 
 
501 aa  222  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1038  Signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 
501 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  37.04 
 
 
513 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
531 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  36.54 
 
 
526 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 
515 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 
509 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  36.28 
 
 
517 aa  220  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  35.1 
 
 
517 aa  219  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3644  histidine kinase  35.86 
 
 
460 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  34.34 
 
 
501 aa  217  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.44 
 
 
515 aa  216  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 
465 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  35.14 
 
 
439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  35.35 
 
 
463 aa  214  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  34.59 
 
 
523 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 
515 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  34.26 
 
 
467 aa  212  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  36.04 
 
 
472 aa  211  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  34.37 
 
 
518 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
515 aa  210  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  34.15 
 
 
817 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3342  histidine kinase  34.79 
 
 
460 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0710689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2963  tricarboxylic transport: regulatory protein  37.59 
 
 
471 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000385279 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2927  tricarboxylic transport: regulatory protein  37.59 
 
 
471 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2980  tricarboxylic transport regulatory protein  37.59 
 
 
471 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.675571 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2896  tricarboxylic transport: regulatory protein  37.59 
 
 
471 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
457 aa  207  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.933036  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1451  histidine kinase  34.22 
 
 
440 aa  207  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.495687  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 
481 aa  207  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  33.89 
 
 
499 aa  206  6e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3083  tricarboxylic transporter regulatory protein  37.35 
 
 
471 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  33.7 
 
 
505 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  33.7 
 
 
505 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  33.7 
 
 
505 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  33.7 
 
 
505 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
462 aa  204  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 
517 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0077  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.74 
 
 
509 aa  201  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3951  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 
484 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 
515 aa  200  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
519 aa  199  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  33.19 
 
 
517 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
487 aa  197  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
517 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
517 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
478 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3333  histidine kinase  35.68 
 
 
468 aa  196  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5198  histidine kinase  32.95 
 
 
481 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1735  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  36.24 
 
 
471 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143515  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0311  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
476 aa  190  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
464 aa  190  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.093144  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1532  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
469 aa  187  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6107  two component sensor kinase  31.89 
 
 
467 aa  187  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3348  histidine kinase  32.64 
 
 
481 aa  186  9e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0882915  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3998  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
493 aa  186  9e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1879  sensor histidine kinase  35.92 
 
 
467 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>