More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6107 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6107  two component sensor kinase  100 
 
 		 467 aa  929    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3644  histidine kinase  71.18 
 
 		 460 aa  617  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3342  histidine kinase  70.31 
 
 		 460 aa  609  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0710689 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  69.23 
 
 		 464 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.093144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0311  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.01 
 
 		 476 aa  466  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2766  histidine kinase  40.46 
 
 		 476 aa  250  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0989044  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  38.48 
 
 		 472 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 474 aa  246  9e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 474 aa  246  9e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 		 463 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  38.24 
 
 		 474 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 		 471 aa  244  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314364  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 		 463 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 		 478 aa  242  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  38.2 
 
 		 472 aa  240  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 		 477 aa  239  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 462 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 476 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  38 
 
 		 504 aa  232  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 457 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.933036  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0953  sensor histidine kinase  38.37 
 
 		 501 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1126  sensor histidine kinase  38.37 
 
 		 501 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0115  sensor histidine kinase  38.37 
 
 		 501 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2278  sensor histidine kinase  38.37 
 
 		 501 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992054  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1500  sensor histidine kinase  38.37 
 
 		 501 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1038  Signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 		 501 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  37.44 
 
 		 439 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  35.46 
 
 		 474 aa  221  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 		 479 aa  217  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  36.66 
 
 		 506 aa  216  9e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1735  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  36.77 
 
 		 471 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  32.97 
 
 		 501 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1450  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 		 460 aa  213  7e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126208  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 463 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 459 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 459 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  34.12 
 
 		 467 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54500  two-component sensor  36.47 
 
 		 460 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.452392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 		 459 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3964  sensor histidine kinase  34.17 
 
 		 460 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 		 465 aa  206  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1355  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 461 aa  204  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 481 aa  204  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.41 
 
 		 515 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0499  histidine kinase  33.33 
 
 		 518 aa  203  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3951  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 484 aa  203  7e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0728  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 467 aa  202  9e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  33.76 
 
 		 496 aa  202  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  33.12 
 
 		 499 aa  202  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3436  sensor histidine kinase  34.74 
 
 		 497 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.999938  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 		 515 aa  201  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3584  histidine kinase  33.33 
 
 		 495 aa  199  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1580  sensor histidine kinase  32.89 
 
 		 462 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1532  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 469 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0058  histidine kinase  33.26 
 
 		 461 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  33.71 
 
 		 460 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1765  sensor histidine kinase  33.41 
 
 		 466 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  31.28 
 
 		 463 aa  197  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2866  histidine kinase  33.69 
 
 		 508 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3935  two-component regulatory system sensory histidine kinase  31.25 
 
 		 475 aa  196  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1365  histidine kinase  32.04 
 
 		 463 aa  193  6e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4637  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 485 aa  193  6e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.337185  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.25 
 
 		 513 aa  193  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1181  sensor histidine kinase  33.64 
 
 		 469 aa  192  8e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3348  histidine kinase  33.62 
 
 		 481 aa  192  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0882915  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3998  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 493 aa  192  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 479 aa  192  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4431  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 		 462 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 509 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 531 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  30.82 
 
 		 526 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 		 524 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0258  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 457 aa  189  8e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.818246  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3336  two component sensor kinase  33.4 
 
 		 473 aa  189  8e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2936  putative transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  33.04 
 
 		 500 aa  189  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2571  histidine kinase  30.36 
 
 		 489 aa  188  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673908 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  31.49 
 
 		 523 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 517 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0077  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.54 
 
 		 509 aa  188  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3012  histidine kinase  31.91 
 
 		 473 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250655  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 		 487 aa  188  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0287  two-component system, sensor protein  31.55 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3339  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 472 aa  188  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.184807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1879  sensor histidine kinase  32.72 
 
 		 467 aa  187  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0497  histidine kinase  33.33 
 
 		 464 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.623662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 515 aa  187  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  31.26 
 
 		 518 aa  187  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4037  histidine kinase  33.79 
 
 		 464 aa  186  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 519 aa  186  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  31.19 
 
 		 517 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 482 aa  185  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  31.32 
 
 		 817 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 515 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 463 aa  184  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5198  histidine kinase  32.56 
 
 		 481 aa  184  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2263  histidine kinase  34.32 
 
 		 477 aa  183  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.043312 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 465 aa  183  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2579  histidine kinase  31.17 
 
 		 466 aa  182  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 515 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  30.8 
 
 		 505 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>