More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0821 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0821  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
715 aa  1470    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.99772  normal  0.688187 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 
625 aa  273  1e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 
628 aa  247  6.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
629 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.54 
 
 
781 aa  206  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371477  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2222  histidine kinase  33.06 
 
 
605 aa  173  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0226681 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 
844 aa  170  8e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  33.43 
 
 
631 aa  170  8e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 
1225 aa  165  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
862 aa  160  6e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 
968 aa  157  7e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1140  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 
563 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 
603 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 
644 aa  153  8.999999999999999e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 
931 aa  152  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339388  normal  0.130033 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
1325 aa  152  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
737 aa  151  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 
500 aa  148  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 
873 aa  148  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 
638 aa  147  5e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.679676  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 
968 aa  147  8.000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 
1050 aa  147  9e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 
1301 aa  146  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 
781 aa  144  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 
581 aa  144  7e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 
472 aa  144  8e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.836728  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 
841 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 
901 aa  140  7e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 
931 aa  139  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 
347 aa  139  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0266  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 
736 aa  138  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 
472 aa  137  8e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 
651 aa  137  9e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 
1425 aa  137  9e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 
1111 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 
472 aa  136  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1055  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 
639 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 
619 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 
935 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 
678 aa  134  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 
813 aa  134  6e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 
544 aa  134  6e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 
813 aa  134  6e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1231  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
366 aa  134  6.999999999999999e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0108298  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2061  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.41 
 
 
600 aa  134  7.999999999999999e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.658977 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0467  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
431 aa  133  9e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.466167  hitchhiker  0.00940458 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1687  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
404 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0708821  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 
753 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.74 
 
 
1253 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
559 aa  132  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 
789 aa  132  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
886 aa  131  4.0000000000000003e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0325  histidine kinase  41.61 
 
 
185 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.28293 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2092  putative PAS/PAC sensor protein  28.79 
 
 
628 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.180005  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2676  histidine kinase  34.98 
 
 
213 aa  130  6e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.364042  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
608 aa  130  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
603 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 
771 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 
1055 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 
657 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0935  histidine kinase  33.18 
 
 
379 aa  128  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.957792  normal  0.0100677 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 
1426 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1433  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 
974 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717996  normal  0.840517 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
1039 aa  127  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2693  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
727 aa  127  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0252521 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1104  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
569 aa  127  6e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53532  normal  0.324425 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
653 aa  127  9e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 
493 aa  126  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.607083 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1963  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 
642 aa  126  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.743491  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
440 aa  126  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1647  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 
638 aa  126  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211834  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.82 
 
 
524 aa  126  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
655 aa  125  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2965  histidine kinase  35.41 
 
 
350 aa  125  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 
1032 aa  124  6e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 
530 aa  124  7e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
732 aa  124  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 
765 aa  123  9e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
729 aa  123  9e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.15545  normal  0.515162 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
766 aa  123  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 
1276 aa  122  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 
1439 aa  122  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 
763 aa  122  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 
589 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1172  histidine kinase  31.82 
 
 
288 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 
1039 aa  120  6e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 
478 aa  120  7e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.260977 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0237  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
440 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 
1758 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 
1078 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
596 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 
896 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
2072 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
1121 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2775  ATP-binding region, ATPase-like  30.92 
 
 
310 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
1513 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
720 aa  118  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2719  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
586 aa  118  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000435656  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 
656 aa  118  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2642  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 
510 aa  118  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.848189  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>