More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_3020 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_3020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 483 aa  983    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.27 
 
 		 473 aa  473  1e-132  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.753978 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2699  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 446 aa  210  4e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.112792  normal  0.0892885 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1800  histidine kinase  43.44 
 
 		 588 aa  203  6e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 991 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39 
 
 		 578 aa  182  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.58 
 
 		 511 aa  180  5.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0103276  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3655  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 858 aa  172  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 		 426 aa  171  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.525056  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3664  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 708 aa  164  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2186  histidine kinase  40.08 
 
 		 383 aa  159  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0452975  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2352  histidine kinase  36.8 
 
 		 387 aa  157  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 1052 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2923  histidine kinase  36.09 
 
 		 385 aa  125  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0771674  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.81 
 
 		 509 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2042  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 		 477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.562637  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2120  histidine kinase  33.61 
 
 		 384 aa  118  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.238176  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 511 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2051  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 		 748 aa  117  6.9999999999999995e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.167205 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.74 
 
 		 472 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 516 aa  114  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0183  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0059  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 729 aa  110  6e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318391  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 		 500 aa  108  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.24 
 
 		 838 aa  107  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1289  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 		 662 aa  107  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0375  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 450 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0348  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  40.91 
 
 		 700 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.45 
 
 		 508 aa  104  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2147  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  45.58 
 
 		 712 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 		 758 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 		 1042 aa  103  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.755924 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0010  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.41 
 
 		 508 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0502065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0324  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 		 464 aa  100  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1643  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 		 739 aa  99.4  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2774  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.49 
 
 		 535 aa  99.8  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0008  sensory box histidine kinase/response regulator  25.2 
 
 		 516 aa  97.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.6 
 
 		 472 aa  97.4  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.836728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0622  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 753 aa  97.4  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1528  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 659 aa  97.4  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.55 
 
 		 553 aa  97.1  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 873 aa  96.7  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  23.8 
 
 		 524 aa  96.7  9e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 		 1195 aa  96.3  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1570  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 		 594 aa  96.3  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138463  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 		 883 aa  96.3  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2748  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.68 
 
 		 476 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.662437  normal  0.393877 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.4 
 
 		 903 aa  96.3  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.644945  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1464  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 		 663 aa  95.1  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 		 603 aa  94.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0421  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 563 aa  94.7  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.410196  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1802  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  36.15 
 
 		 572 aa  94.7  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 		 1131 aa  94.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2850  histidine kinase  31.16 
 
 		 343 aa  94  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0497366  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.44 
 
 		 579 aa  93.2  9e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.352979  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1140  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 563 aa  92.4  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1055  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.98 
 
 		 639 aa  92.4  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2079  putative PAS/PAC sensor protein  28.72 
 
 		 666 aa  91.3  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1743  histidine kinase  27.3 
 
 		 559 aa  91.7  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1000  histidine kinase  27.35 
 
 		 582 aa  91.3  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0510  putative PAS/PAC sensor protein  48.94 
 
 		 455 aa  91.3  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3015  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.51 
 
 		 500 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 625 aa  90.5  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 		 438 aa  90.5  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.94 
 
 		 484 aa  90.5  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 626 aa  89.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1531  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.04 
 
 		 643 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1590  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 447 aa  89.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 		 654 aa  89.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.36 
 
 		 1118 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2847  PAS  24.64 
 
 		 764 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.445085  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.97 
 
 		 896 aa  88.6  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 		 817 aa  89  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.27 
 
 		 1691 aa  88.2  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.96 
 
 		 562 aa  88.2  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.121796  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0519  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 531 aa  88.2  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 361 aa  88.2  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.121387  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2607  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.86 
 
 		 1144 aa  87.8  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 759 aa  87.8  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0228  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.85 
 
 		 541 aa  87.4  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5080  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 		 677 aa  87.4  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.56 
 
 		 1039 aa  87  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  32.68 
 
 		 1113 aa  86.7  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0201  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 		 408 aa  86.7  8e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.22 
 
 		 477 aa  86.7  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 984 aa  86.7  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.09 
 
 		 763 aa  86.7  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 608 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.09 
 
 		 1045 aa  86.3  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1892  putative PAS/PAC sensor protein  35.91 
 
 		 632 aa  86.3  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.487702  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3337  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 685 aa  85.5  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2967  putative PAS/PAC sensor protein  31.84 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3582  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 516 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 		 735 aa  85.1  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  24.14 
 
 		 3706 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3822  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 		 717 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.834811  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 1426 aa  85.1  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0175  histidine kinase  30.63 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0979792  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0884  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 		 807 aa  84.7  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00331872  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3766  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.06 
 
 		 717 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>