More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0510 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0510  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 455 aa  926    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.59 
 
 		 896 aa  229  6e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 759 aa  223  4e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.37 
 
 		 758 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.33 
 
 		 991 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0348  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  53.6 
 
 		 700 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.74 
 
 		 921 aa  136  8e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.627886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1892  putative PAS/PAC sensor protein  47.69 
 
 		 632 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.487702  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.66 
 
 		 1045 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 781 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3337  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.22 
 
 		 685 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2042  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.18 
 
 		 477 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.562637  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2147  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  48.84 
 
 		 712 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0622  putative PAS/PAC sensor protein  25.55 
 
 		 440 aa  124  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1649  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 		 550 aa  120  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.181327  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.37 
 
 		 783 aa  121  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.22 
 
 		 1032 aa  117  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.16 
 
 		 656 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2464  putative PAS/PAC sensor protein  25.22 
 
 		 812 aa  111  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 		 657 aa  111  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  25.72 
 
 		 906 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 		 544 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 		 530 aa  109  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 1325 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2699  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.61 
 
 		 446 aa  103  9e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.112792  normal  0.0892885 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 473 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.753978 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.54 
 
 		 1276 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3023  response regulator receiver protein  37.8 
 
 		 129 aa  101  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 		 603 aa  100  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.29 
 
 		 660 aa  100  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3274  response regulator receiver protein  32.25 
 
 		 539 aa  99  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 		 1039 aa  97.8  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0141  putative PAS/PAC sensor protein  41.67 
 
 		 837 aa  97.8  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00355903 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 		 1426 aa  98.2  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.62 
 
 		 653 aa  98.2  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1762  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 		 830 aa  97.4  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1245  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 		 400 aa  97.1  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 		 644 aa  95.9  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 		 862 aa  95.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 901 aa  95.5  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 		 1439 aa  95.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1709  putative PAS/PAC sensor protein  25.15 
 
 		 669 aa  94.7  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0628445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.52 
 
 		 771 aa  94  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 765 aa  93.6  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  37.98 
 
 		 637 aa  93.6  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 		 813 aa  92.4  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 1078 aa  92  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2967  putative PAS/PAC sensor protein  37.69 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  42.4 
 
 		 1265 aa  92  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3311  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 1300 aa  92  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.703453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1714  putative PAS/PAC sensor protein  38.84 
 
 		 920 aa  91.3  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.183434  normal  0.382108 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.94 
 
 		 483 aa  91.3  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 		 886 aa  90.5  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2079  putative PAS/PAC sensor protein  36.72 
 
 		 666 aa  90.1  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 875 aa  89.7  9e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 593 aa  89  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 		 2072 aa  88.6  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2388  response regulator receiver  40.65 
 
 		 127 aa  88.2  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0389923  normal  0.541574 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 		 769 aa  88.2  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.46 
 
 		 1513 aa  87.8  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 768 aa  88.2  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.1 
 
 		 873 aa  87.4  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 		 753 aa  87.8  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 603 aa  87.8  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 896 aa  87.4  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 		 789 aa  87.4  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 		 871 aa  87.4  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.363033  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  43.8 
 
 		 909 aa  87  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 		 603 aa  87  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 		 763 aa  86.7  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0184  histidine kinase  25.93 
 
 		 511 aa  85.9  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1899  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 121 aa  86.3  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.896826 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 		 1301 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 608 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  36.84 
 
 		 511 aa  85.1  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 766 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1607  response regulator receiver domain-containing protein  33.81 
 
 		 186 aa  84.7  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 764 aa  84.7  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  39.2 
 
 		 1113 aa  84.3  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 		 931 aa  84.3  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 468 aa  84  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 1253 aa  84  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0840  response regulator receiver domain-containing protein  38.93 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.351248  normal  0.247104 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1470  response regulator receiver protein  32.29 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00118197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 		 873 aa  83.6  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0709  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  22.9 
 
 		 564 aa  82.4  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1643  response regulator receiver domain-containing protein  33.59 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.831648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0264  response regulator receiver domain-containing protein  35.2 
 
 		 178 aa  80.9  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2673  response regulator receiver domain-containing protein  38.71 
 
 		 133 aa  80.9  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0642  putative PAS/PAC sensor protein  35.42 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201186  normal  0.0191068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2968  putative PAS/PAC sensor protein  33.08 
 
 		 479 aa  80.5  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1670  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 		 632 aa  79.7  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  33.86 
 
 		 849 aa  79.7  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.35 
 
 		 1111 aa  79.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 		 720 aa  79.7  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 878 aa  79  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 619 aa  78.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.51 
 
 		 984 aa  79  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 		 500 aa  78.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 1039 aa  77.8  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>