More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2079 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2079  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
666 aa  1343    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1262  putative PAS/PAC sensor protein  33.64 
 
 
532 aa  161  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0317  bacterio-opsin activator  27.52 
 
 
680 aa  151  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0128  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  28.99 
 
 
728 aa  150  9e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0011  putative PAS/PAC sensor protein  31.11 
 
 
781 aa  144  7e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.206274  normal  0.555511 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1747  putative PAS/PAC sensor protein  30.75 
 
 
524 aa  140  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5215  putative PAS/PAC sensor protein  31.84 
 
 
677 aa  136  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2813  putative PAS/PAC sensor protein  29.76 
 
 
991 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4080  putative PAS/PAC sensor protein  29.57 
 
 
1081 aa  135  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4237  putative PAS/PAC sensor protein  27.18 
 
 
843 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.28007  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3274  response regulator receiver protein  29.79 
 
 
539 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  31.63 
 
 
1589 aa  134  6.999999999999999e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0150  putative PAS/PAC sensor protein  30.79 
 
 
1969 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0709  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  29.23 
 
 
564 aa  131  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4272  putative PAS/PAC sensor protein  29.7 
 
 
919 aa  131  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.312579  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.88 
 
 
991 aa  131  5.0000000000000004e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2692  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  29.38 
 
 
637 aa  129  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4113  putative PAS/PAC sensor protein  29.62 
 
 
896 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2698  putative PAS/PAC sensor protein  32.01 
 
 
553 aa  127  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1371  putative PAS/PAC sensor protein  28.89 
 
 
834 aa  127  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 
921 aa  126  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.627886  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2147  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  48.25 
 
 
712 aa  126  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0348  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  47.83 
 
 
700 aa  123  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3482  putative PAS/PAC sensor protein  29.82 
 
 
994 aa  120  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.48 
 
 
769 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  32.75 
 
 
849 aa  118  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2128  putative PAS/PAC sensor protein  26.59 
 
 
1059 aa  118  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0050  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.32 
 
 
440 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  34.47 
 
 
1265 aa  115  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3382  putative PAS/PAC sensor protein  28.02 
 
 
952 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3337  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
685 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 
758 aa  114  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0680  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.12 
 
 
1301 aa  114  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.344906  normal  0.0177864 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3168  putative PAS/PAC sensor protein  27.05 
 
 
807 aa  113  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1541  putative PAS/PAC sensor protein  25.36 
 
 
1071 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1892  putative PAS/PAC sensor protein  33.2 
 
 
632 aa  110  7.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.487702  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0054  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.54 
 
 
467 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0977  putative PAS/PAC sensor protein  27.78 
 
 
737 aa  110  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0683  putative PAS/PAC sensor protein  29.19 
 
 
750 aa  109  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987157  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 
603 aa  110  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
593 aa  109  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.45 
 
 
896 aa  109  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1825  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.64 
 
 
879 aa  109  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3905  putative PAS/PAC sensor protein  26.88 
 
 
537 aa  107  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 
720 aa  107  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 
603 aa  106  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4116  putative PAS/PAC sensor protein  28.96 
 
 
982 aa  106  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.147835  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
473 aa  105  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.753978 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2534  sensory box/response regulator  32.71 
 
 
452 aa  105  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0043  putative PAS/PAC sensor protein  27.38 
 
 
1216 aa  105  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2042  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 
477 aa  105  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.562637  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  29.29 
 
 
637 aa  101  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 
1045 aa  101  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2699  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
446 aa  100  7e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.112792  normal  0.0892885 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 
984 aa  99.8  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
886 aa  99  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 
878 aa  97.8  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.97 
 
 
773 aa  97.1  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
789 aa  96.3  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2350  putative PAS/PAC sensor protein  29.21 
 
 
450 aa  95.5  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1305  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.47 
 
 
598 aa  95.5  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 
657 aa  95.1  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.514383  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.92 
 
 
773 aa  94.4  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.45 
 
 
637 aa  93.6  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3065  putative PAS/PAC sensor protein  28.17 
 
 
770 aa  92.4  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 
759 aa  92.8  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 
1121 aa  92.4  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 
608 aa  91.7  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  30.5 
 
 
642 aa  91.7  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 
483 aa  91.3  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0553  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.81 
 
 
699 aa  90.9  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5264  putative PAS/PAC sensor protein  27.69 
 
 
1073 aa  90.9  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.255684  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0510  putative PAS/PAC sensor protein  36.72 
 
 
455 aa  90.1  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  29.75 
 
 
642 aa  88.2  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3054  putative PAS/PAC sensor protein  27.03 
 
 
1260 aa  87.4  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1762  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 
830 aa  87.4  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4350  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.15 
 
 
726 aa  87  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.46 
 
 
468 aa  86.7  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 
862 aa  86.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
873 aa  86.3  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 
765 aa  85.9  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1202  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.3 
 
 
1126 aa  85.9  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.766255  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3311  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 
1300 aa  86.3  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.703453  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0662  putative PAS/PAC sensor protein  26.67 
 
 
644 aa  85.1  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4412  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.81 
 
 
726 aa  85.1  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
1426 aa  84.3  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2551  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  27.59 
 
 
765 aa  84.7  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.274696 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 
753 aa  84.3  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 
769 aa  83.2  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 
1135 aa  83.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0933  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 
760 aa  83.6  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  25.12 
 
 
1629 aa  83.2  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0010  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.1 
 
 
508 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0502065  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2967  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
376 aa  82.8  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2748  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.36 
 
 
476 aa  82  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.662437  normal  0.393877 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 
766 aa  82  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1649  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 
550 aa  82  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.181327  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  27.6 
 
 
511 aa  82  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 
873 aa  81.6  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>