More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2923 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2923  histidine kinase  100 
 
 
385 aa  764    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0771674  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2120  histidine kinase  63.54 
 
 
384 aa  432  1e-120  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.238176  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3655  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
858 aa  133  6e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
991 aa  130  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 
483 aa  125  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 
516 aa  124  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
473 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.753978 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1800  histidine kinase  37.99 
 
 
588 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3664  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
708 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
578 aa  103  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2186  histidine kinase  31.47 
 
 
383 aa  102  9e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0452975  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 
1568 aa  102  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2352  histidine kinase  31.93 
 
 
387 aa  102  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2385  histidine kinase  35.22 
 
 
337 aa  101  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0324  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 
464 aa  100  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0519  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 
531 aa  97.8  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 
426 aa  97.4  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.525056  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
511 aa  95.9  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0103276  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0375  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
450 aa  94.4  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 
659 aa  93.2  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.23 
 
 
576 aa  92  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1643  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 
739 aa  92.4  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
793 aa  90.5  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.73474  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 
625 aa  89.7  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0884  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 
807 aa  89.4  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00331872  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0028  histidine kinase  31.19 
 
 
362 aa  87.4  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.801683  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1528  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
659 aa  87.4  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0059  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 
729 aa  87  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318391  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0497  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.91 
 
 
1181 aa  86.7  6e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0175  histidine kinase  30 
 
 
322 aa  85.5  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0979792  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 
700 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 
735 aa  84.7  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0958  ATP-binding region, ATPase-like protein  26.91 
 
 
563 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 
654 aa  83.6  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0421  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 
563 aa  83.6  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.410196  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0313  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
580 aa  82.8  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0157  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 
1329 aa  82.8  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2389  histidine kinase  28.44 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0317166  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1023  Cache sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 
723 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 
800 aa  81.3  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 
628 aa  81.3  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2243  histidine kinase  28.37 
 
 
376 aa  80.1  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.312206 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.7 
 
 
543 aa  80.1  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.624689  normal  0.503479 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1707  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 
535 aa  79.7  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.366818  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 
466 aa  79.7  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3606  histidine kinase  28.93 
 
 
573 aa  79.7  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.35 
 
 
810 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1549  histidine kinase  27.27 
 
 
598 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.924403  normal  0.563022 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
598 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.078149 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
598 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
598 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2180  histidine kinase  30 
 
 
530 aa  78.2  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
468 aa  78.6  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3302  histidine kinase  28.93 
 
 
573 aa  78.6  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3856  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
378 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1136  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
608 aa  78.2  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2820  histidine kinase  29.65 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2051  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 
748 aa  76.6  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.167205 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1570  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 
594 aa  76.6  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138463  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0111  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
497 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717737  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.25 
 
 
873 aa  76.3  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
590 aa  76.3  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0184  histidine kinase  31.54 
 
 
511 aa  76.3  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31584  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3558  sensor histidine kinase  27.07 
 
 
512 aa  76.3  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1725  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 
407 aa  76.3  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1646  histidine kinase  30.84 
 
 
446 aa  76.3  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0278  histidine kinase  27.67 
 
 
471 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.182643 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2916  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 
691 aa  75.9  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 
425 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3828  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 
392 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.287383  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 
530 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104669  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.24 
 
 
524 aa  75.1  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0262  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 
523 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 
758 aa  75.1  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
629 aa  74.7  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18050  signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 
458 aa  75.5  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0183  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 
390 aa  74.7  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1870  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181656  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.73 
 
 
678 aa  73.9  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0555  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 
416 aa  73.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.564143 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  26.99 
 
 
902 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1464  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 
663 aa  73.6  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1413  ATPase domain-containing protein  27.96 
 
 
603 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0274  sensor histidine kinase  28.46 
 
 
541 aa  73.2  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 
472 aa  73.2  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.209845  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2889  histidine kinase  30.77 
 
 
549 aa  72.8  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 
460 aa  73.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.11 
 
 
593 aa  73.2  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6083  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 
478 aa  73.2  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 
517 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0178  histidine kinase  28.16 
 
 
557 aa  72.4  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.283442  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 
603 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0943  histidine kinase  26.67 
 
 
530 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.215183  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2813  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 
590 aa  72  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218828  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3657  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
478 aa  71.6  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1028  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  27.54 
 
 
1248 aa  72  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.507304 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.87 
 
 
438 aa  71.6  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1425  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 
603 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.73 
 
 
637 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>