More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2748 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2748  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  100 
 
 
476 aa  979    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.662437  normal  0.393877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0754  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.88 
 
 
492 aa  348  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.499334  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 
477 aa  333  5e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.23 
 
 
630 aa  240  5e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2408  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 
647 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385618  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0788  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.34 
 
 
634 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.23 
 
 
637 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.1 
 
 
819 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3015  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 
500 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 
738 aa  150  7e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4645  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.21 
 
 
644 aa  149  9e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224961  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.71 
 
 
819 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.59 
 
 
654 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.33 
 
 
744 aa  147  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.52 
 
 
641 aa  143  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  31.71 
 
 
611 aa  141  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  29.07 
 
 
608 aa  140  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  29.07 
 
 
608 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.07 
 
 
608 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  29.07 
 
 
608 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  29.07 
 
 
608 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 
1131 aa  139  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  29.07 
 
 
608 aa  138  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1412  sensor histidine kinase/response regulator  30.27 
 
 
737 aa  137  4e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.281366  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2293  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.31 
 
 
782 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  28.46 
 
 
1092 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.32 
 
 
801 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0915  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.78 
 
 
362 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.115848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 
655 aa  133  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
515 aa  133  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2816  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.85 
 
 
682 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0864703 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  23.65 
 
 
553 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2264  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.53 
 
 
692 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
655 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1662  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
396 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1525  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.25 
 
 
653 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0183917  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2551  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
396 aa  130  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14529e-19 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.12 
 
 
804 aa  130  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 
507 aa  129  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0201  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
408 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.91 
 
 
650 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0675  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.02 
 
 
855 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4355  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.02 
 
 
638 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201871  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4378  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.02 
 
 
627 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.055155  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.64 
 
 
810 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  27.78 
 
 
1836 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.38 
 
 
567 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5651  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 
801 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.285543 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4222  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.8 
 
 
627 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288914  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 
970 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1745  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.17 
 
 
424 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.18 
 
 
1509 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1355  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.25 
 
 
929 aa  127  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.968718  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
656 aa  127  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2787  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.75 
 
 
365 aa  126  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220649  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  27.12 
 
 
363 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.4 
 
 
547 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1746  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  30.3 
 
 
506 aa  126  8.000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0622  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 
753 aa  126  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  26.23 
 
 
1299 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  35.17 
 
 
830 aa  125  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3327  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.65 
 
 
510 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.26559  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0670  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.58 
 
 
546 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0451507  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3007  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.44 
 
 
507 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.738719  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2679  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 
544 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  33.64 
 
 
656 aa  126  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1751  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 
671 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1119  sensor histidine kinase/response regulator  32.89 
 
 
420 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.94 
 
 
541 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0714  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 
744 aa  125  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.65 
 
 
1080 aa  125  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1952  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.25 
 
 
692 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1389  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30 
 
 
550 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.531963  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1502  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.17 
 
 
952 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.13 
 
 
586 aa  124  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1250  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  29.78 
 
 
506 aa  124  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.112207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 
542 aa  124  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2430  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.81 
 
 
420 aa  124  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3535  histidine kinase  34.63 
 
 
410 aa  124  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.74 
 
 
598 aa  123  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.74 
 
 
556 aa  123  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1970  sensory box histidine kinase  27.17 
 
 
415 aa  123  7e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.645732  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  26.43 
 
 
1379 aa  123  7e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1269  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.73 
 
 
509 aa  123  9e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 
595 aa  123  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0288015  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2653  sensor histidine kinase  25.86 
 
 
595 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000377576 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2419  sensor histidine kinase  25.86 
 
 
595 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.131968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2380  sensor histidine kinase  25.86 
 
 
595 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.343005  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
510 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2495  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.44 
 
 
363 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1557  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 
773 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468664  hitchhiker  0.00480077 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3670  sporulation kinase A  26.61 
 
 
510 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.825905  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  34.21 
 
 
581 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.43 
 
 
653 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697975  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3674  sporulation kinase A  26.61 
 
 
510 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.123371  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2317  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.82 
 
 
657 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.553373  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 
514 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4372  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.48 
 
 
641 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.755089  normal  0.0153537 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1384  sensory histidine kinase AtoS  27.45 
 
 
617 aa  121  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 
480 aa  121  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>