More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2092 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2092  histidine kinase  100 
 
 		 534 aa  1095    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.865135  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  30.67 
 
 		 560 aa  244  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 546 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1010  histidine kinase  29.72 
 
 		 572 aa  226  9e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0817847 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  26.94 
 
 		 582 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 641 aa  201  3e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 639 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4693  histidine kinase  26.7 
 
 		 561 aa  197  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 		 614 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 		 639 aa  194  4e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11300  signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 556 aa  194  4e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 639 aa  193  8e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 		 467 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1502  Histidine kinase  41.89 
 
 		 919 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 		 640 aa  184  3e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 		 901 aa  182  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  40 
 
 		 903 aa  182  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  39.78 
 
 		 927 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3217  ATP-binding region ATPase domain protein  29.19 
 
 		 576 aa  181  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.644054  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 613 aa  178  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 919 aa  177  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 		 932 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 487 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  26.82 
 
 		 655 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.55 
 
 		 1043 aa  174  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.31 
 
 		 827 aa  174  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0236  histidine kinase  38.18 
 
 		 935 aa  173  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00442274 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2650  ATP-binding region ATPase domain protein  40.22 
 
 		 913 aa  172  9e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 		 614 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.33 
 
 		 933 aa  171  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 		 919 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 457 aa  170  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 		 579 aa  170  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 620 aa  169  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0666  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 917 aa  168  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3055  histidine kinase  28.79 
 
 		 562 aa  168  2.9999999999999998e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.75 
 
 		 917 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 488 aa  167  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 646 aa  167  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  34.17 
 
 		 659 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  41.81 
 
 		 1629 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 		 922 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 945 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 		 917 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.34 
 
 		 1002 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 473 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 592 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 920 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.56 
 
 		 916 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  37.29 
 
 		 539 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.68 
 
 		 937 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  32.29 
 
 		 925 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.28 
 
 		 917 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.07 
 
 		 927 aa  162  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.21 
 
 		 780 aa  162  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  30.34 
 
 		 917 aa  161  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  30.35 
 
 		 455 aa  161  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  30.35 
 
 		 455 aa  161  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  33.11 
 
 		 810 aa  161  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  28.31 
 
 		 932 aa  161  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  30.34 
 
 		 917 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.3 
 
 		 932 aa  160  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 470 aa  160  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  31.97 
 
 		 925 aa  160  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  39.15 
 
 		 352 aa  159  9e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0986  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.08 
 
 		 921 aa  159  9e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000725177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  28.43 
 
 		 496 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.42 
 
 		 944 aa  159  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 		 421 aa  159  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00283134  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  33.63 
 
 		 1133 aa  159  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 		 906 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  37.27 
 
 		 762 aa  159  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0212  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.22 
 
 		 953 aa  158  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0102  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 		 763 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.86 
 
 		 1021 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.85 
 
 		 933 aa  158  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 462 aa  158  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  36.26 
 
 		 906 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.47 
 
 		 906 aa  157  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.37 
 
 		 918 aa  157  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 493 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  30.45 
 
 		 1119 aa  157  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  27.77 
 
 		 835 aa  156  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 452 aa  156  9e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 		 875 aa  156  9e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  29.63 
 
 		 918 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.63 
 
 		 918 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.18 
 
 		 929 aa  156  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.63 
 
 		 918 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 1029 aa  156  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  30.63 
 
 		 641 aa  156  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0510  Cache sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 633 aa  156  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 		 631 aa  155  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.963931  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.63 
 
 		 918 aa  155  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2257  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.67 
 
 		 1162 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.63 
 
 		 918 aa  155  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.63 
 
 		 918 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.63 
 
 		 918 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 979 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 		 743 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>