More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4907 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 557 aa  1132    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.125124  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3611  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.61 
 
 		 577 aa  499  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.33 
 
 		 579 aa  489  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0496  histidine kinase  46.25 
 
 		 554 aa  418  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434752 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  46.93 
 
 		 910 aa  256  7e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  43.71 
 
 		 998 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.2 
 
 		 791 aa  256  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.87 
 
 		 917 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.32 
 
 		 977 aa  248  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  46.91 
 
 		 970 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  48.65 
 
 		 927 aa  226  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.69 
 
 		 1003 aa  223  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.55 
 
 		 641 aa  219  7.999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.15 
 
 		 1022 aa  219  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.95 
 
 		 858 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0615  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 		 395 aa  218  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0544  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 		 569 aa  214  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0148365  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.02 
 
 		 974 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.62 
 
 		 796 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.68 
 
 		 386 aa  213  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000238922  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  46.85 
 
 		 882 aa  211  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.4 
 
 		 975 aa  211  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  36.11 
 
 		 1001 aa  210  6e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.21 
 
 		 1005 aa  210  7e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3362  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 		 575 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.516975 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 		 699 aa  208  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1975  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.39 
 
 		 633 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  39.65 
 
 		 923 aa  206  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 574 aa  204  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  42.55 
 
 		 1137 aa  203  8e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0559  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.07 
 
 		 704 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.5 
 
 		 687 aa  201  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0606  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 		 785 aa  200  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.05 
 
 		 765 aa  200  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.02 
 
 		 767 aa  200  6e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  42.51 
 
 		 576 aa  199  9e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  37.65 
 
 		 620 aa  197  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.81 
 
 		 631 aa  197  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 		 1240 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.65 
 
 		 1596 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2818  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.82 
 
 		 720 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.215558  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02943  two-component system sensor protein  44.03 
 
 		 727 aa  196  7e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00726909  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  44.21 
 
 		 792 aa  196  7e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4222  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.82 
 
 		 1002 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480663  normal  0.970552 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.84 
 
 		 984 aa  196  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.21 
 
 		 803 aa  196  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2415  PAS sensor protein  43.63 
 
 		 810 aa  195  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0930  autoinducer 2 sensor kinase/phosphatase LuxQ  38.24 
 
 		 745 aa  195  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.407663  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.57 
 
 		 1124 aa  195  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.02 
 
 		 1433 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.86 
 
 		 798 aa  195  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.03 
 
 		 763 aa  195  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.57 
 
 		 1168 aa  195  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.58 
 
 		 1137 aa  195  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0666  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.42 
 
 		 1400 aa  195  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.982341 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.63 
 
 		 781 aa  194  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 		 932 aa  194  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 646 aa  194  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  40.08 
 
 		 1193 aa  194  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4963  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  43.92 
 
 		 1122 aa  194  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0522  two component sensor kinase/response regulator hybrid  44.17 
 
 		 751 aa  194  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.98 
 
 		 870 aa  194  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  42.96 
 
 		 1346 aa  194  5e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.31 
 
 		 833 aa  193  6e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  38.02 
 
 		 659 aa  193  6e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.83 
 
 		 957 aa  193  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.45 
 
 		 1350 aa  193  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3308  sensor histidine kinase  36.41 
 
 		 845 aa  193  9e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 		 1203 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.45 
 
 		 940 aa  192  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1728  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.92 
 
 		 1120 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.87 
 
 		 1369 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1424  sensor histidine kinase  39.15 
 
 		 736 aa  191  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.69 
 
 		 817 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2746  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.28 
 
 		 596 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.313231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.57 
 
 		 1550 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 		 937 aa  192  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.18 
 
 		 770 aa  192  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.4 
 
 		 1068 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  39.56 
 
 		 758 aa  192  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.42 
 
 		 1165 aa  192  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 		 581 aa  192  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00493244  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.02 
 
 		 781 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  37.7 
 
 		 1170 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 		 759 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.91 
 
 		 860 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.53 
 
 		 1069 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.39 
 
 		 919 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.91 
 
 		 881 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.69 
 
 		 1007 aa  191  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.17 
 
 		 1410 aa  191  4e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.53 
 
 		 1691 aa  191  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.3 
 
 		 865 aa  190  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  45.38 
 
 		 853 aa  190  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.33 
 
 		 1611 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.57 
 
 		 568 aa  190  5.999999999999999e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.28 
 
 		 1363 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1250  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 		 936 aa  190  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.73 
 
 		 823 aa  190  5.999999999999999e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2934  PAS  43.96 
 
 		 955 aa  190  7e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000914767  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>