More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1029 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1029  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
474 aa  958    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 
546 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1500  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 
590 aa  134  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 
725 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0937  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 
534 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0830916  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2527  histidine kinase  32.21 
 
 
535 aa  120  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0731082 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4983  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
535 aa  119  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0185741 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2371  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
1171 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.516834  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 
608 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1550  ATP-binding region, ATPase-like protein  30.11 
 
 
531 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  0.141787 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 
609 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 
535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0433443  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 
815 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 
827 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 
535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 
592 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3806  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 
533 aa  113  7.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.576691  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  29.27 
 
 
591 aa  113  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3839  two-component sensor PhoR  25.94 
 
 
434 aa  113  9e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000175105  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 
556 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0666549 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 
581 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0746  histidine kinase  28.07 
 
 
337 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000736417  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2114  ATP-binding region ATPase domain protein  30.58 
 
 
400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.673781 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0305  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
754 aa  111  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 
556 aa  111  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.236595  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 
446 aa  110  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000449051 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 
499 aa  110  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158171  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0996  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 
396 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.778544  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6283  alginate biosynthesis sensor protein KinB  29.51 
 
 
595 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2387  histidine kinase  31.6 
 
 
400 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
348 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000063575 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72390  putative two-component sensor  29.8 
 
 
595 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 
619 aa  107  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
452 aa  107  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2815  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.3 
 
 
412 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0052  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
348 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
733 aa  107  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0792  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 
592 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.389456  hitchhiker  0.00398352 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  26.97 
 
 
617 aa  106  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2634  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 
451 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0932991  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3103  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
522 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5322  histidine kinase sensor  32.33 
 
 
529 aa  106  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4302  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
348 aa  106  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.269088  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 
816 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3251  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
418 aa  106  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35487  normal  0.0265543 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2720  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.3 
 
 
407 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5362  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 
643 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 
593 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0074  histidine kinase  33.46 
 
 
493 aa  106  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.376042  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 
473 aa  106  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 
686 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000161382  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2074  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 
489 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.104517  normal  0.105314 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 
639 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2661  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 
602 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0056  histidine kinase  32.84 
 
 
348 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 
455 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.89 
 
 
2783 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6390  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.68 
 
 
770 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.186908 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5642  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.42 
 
 
768 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2133  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
678 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 
614 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
695 aa  105  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0041  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 
967 aa  105  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.538382  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1022  histidine kinase  27.78 
 
 
580 aa  104  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 
1138 aa  104  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 
1043 aa  104  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.51 
 
 
587 aa  104  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3784  histidine kinase  27.45 
 
 
496 aa  104  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540279  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  28.82 
 
 
537 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4365  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 
514 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108097  normal  0.083954 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4164  putative periplasmic CHASE2 sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 
819 aa  103  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0288  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
884 aa  103  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1498  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
1070 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.308131  normal  0.537019 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 
611 aa  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0074  histidine kinase  28.53 
 
 
492 aa  103  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  28.36 
 
 
613 aa  103  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1039  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.39 
 
 
1259 aa  103  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
384 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  28.39 
 
 
903 aa  103  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1776  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 
710 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.548217  normal  0.563692 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 
585 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 
1017 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.93 
 
 
458 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7014  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.8 
 
 
781 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 
589 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1160  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.97 
 
 
829 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.380489 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.1 
 
 
734 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.656612  hitchhiker  0.0000890263 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
484 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.173911 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 
456 aa  102  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0613  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 
472 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773099  normal  0.773415 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 
448 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.067404 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
348 aa  101  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.230731  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
736 aa  100  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273222  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3854  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
386 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2188  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 
413 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 
600 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0977  histidine kinase  28.36 
 
 
551 aa  100  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0254133 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0737  histidine kinase  32.17 
 
 
455 aa  100  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00375027  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1931  ATPase domain-containing protein  31.14 
 
 
423 aa  100  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.508093  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
701 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>