More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0028 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0028  histidine kinase  100 
 
 		 362 aa  721    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.801683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2425  membrane bound his kinase A  37.13 
 
 		 350 aa  191  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0749883  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2051  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 748 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.167205 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2850  histidine kinase  31.86 
 
 		 343 aa  133  5e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0497366  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1570  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 594 aa  129  6e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138463  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0421  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 		 563 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.410196  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1052 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2385  histidine kinase  28.89 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2820  histidine kinase  32.88 
 
 		 265 aa  113  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 438 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0253  histidine kinase  31.69 
 
 		 588 aa  107  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0178  histidine kinase  33.63 
 
 		 557 aa  107  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.283442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2186  histidine kinase  26.97 
 
 		 383 aa  106  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0452975  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 		 1042 aa  106  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.755924 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 689 aa  104  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0175  histidine kinase  30.8 
 
 		 322 aa  103  6e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0979792  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 516 aa  102  9e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2389  histidine kinase  33.18 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0317166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1265  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 574 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3059  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 493 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0919  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 404 aa  99  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000529164 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1743  histidine kinase  30.99 
 
 		 559 aa  98.6  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2976  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 732 aa  97.8  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.98148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 603 aa  97.8  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1802  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.25 
 
 		 572 aa  96.3  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 587 aa  95.1  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 991 aa  92.4  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 426 aa  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.525056  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 562 aa  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.121796  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0851  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 469 aa  90.9  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0355773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1800  histidine kinase  29.41 
 
 		 588 aa  90.1  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1704  histidine kinase  31.33 
 
 		 294 aa  90.1  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.318661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 579 aa  89  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.352979  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 351 aa  87.8  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2652  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.77 
 
 		 598 aa  87.8  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2923  histidine kinase  31.19 
 
 		 385 aa  87.4  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0771674  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1464  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 		 663 aa  87  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2352  histidine kinase  29.88 
 
 		 387 aa  86.3  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 655 aa  85.1  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 578 aa  85.1  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 654 aa  82.8  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 511 aa  81.6  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0103276  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1000  histidine kinase  27.47 
 
 		 582 aa  81.3  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2120  histidine kinase  31.46 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.238176  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 472 aa  78.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.209845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 		 456 aa  78.2  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0375  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 450 aa  77  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0183  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3664  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 708 aa  75.9  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 763 aa  75.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1333  histidine kinase  28.83 
 
 		 515 aa  74.7  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.319012  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.51 
 
 		 483 aa  73.6  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2243  histidine kinase  27.56 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.312206 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1643  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 739 aa  69.7  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2158  histidine kinase  26.35 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.249399  normal  0.778679 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0715  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 618 aa  69.3  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0059  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.65 
 
 		 729 aa  68.6  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318391  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 466 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228707 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1946  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 734 aa  67  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0751397  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3655  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 		 858 aa  66.2  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.21 
 
 		 810 aa  66.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 465 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.883894 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0318  putative PAS/PAC sensor protein  38.35 
 
 		 590 aa  65.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375606  normal  0.106516 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2591  sensor protein RstB  29.68 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.17 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.753978 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 		 768 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 		 478 aa  62.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  30.59 
 
 		 460 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2916  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 691 aa  61.6  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2665  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 467 aa  61.6  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11798  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.83 
 
 		 813 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 572 aa  61.2  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.578551  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 		 671 aa  60.5  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202041  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  34.26 
 
 		 471 aa  60.8  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.14 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 504 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.46 
 
 		 753 aa  60.1  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1632  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 		 513 aa  59.7  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00192996  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1234  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.11 
 
 		 552 aa  59.7  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.397898  normal  0.016153 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.89 
 
 		 439 aa  59.7  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.622382  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3304  sensor histidine kinase BaeS  22.79 
 
 		 514 aa  59.7  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0643  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 		 616 aa  59.3  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1024  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 		 682 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000464711  normal  0.0237782 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1537  histidine kinase  28.69 
 
 		 334 aa  59.3  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.496885  normal  0.0588586 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2813  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 590 aa  58.9  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.61 
 
 		 841 aa  58.9  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.43 
 
 		 608 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.19 
 
 		 498 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 873 aa  59.3  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1455  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.96 
 
 		 753 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.205006  normal  0.134875 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2180  histidine kinase  26.61 
 
 		 530 aa  58.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  25 
 
 		 465 aa  58.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 		 638 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.679676  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.55 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0317  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2296  signal transduction histidine kinase  25.89 
 
 		 541 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0982064  normal  0.378772 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7077  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 480 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 968 aa  57.4  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22040  signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>