More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1440 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
351 aa  709    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1265  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 
574 aa  153  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 
1052 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2051  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
748 aa  143  5e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.167205 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1743  histidine kinase  40.43 
 
 
559 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1464  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 
663 aa  134  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
1042 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.755924 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0421  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 
563 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.410196  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 
654 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 
579 aa  123  5e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.352979  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1704  histidine kinase  31.27 
 
 
294 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.318661  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1000  histidine kinase  34.33 
 
 
582 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798946  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1570  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 
594 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138463  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0851  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 
469 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0355773  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1800  histidine kinase  33.06 
 
 
588 aa  114  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 
655 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2389  histidine kinase  34.13 
 
 
298 aa  110  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0317166  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
472 aa  109  6e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.209845  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
991 aa  108  9.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3059  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 
493 aa  109  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1946  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
734 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0751397  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2652  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.4 
 
 
598 aa  108  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0253  histidine kinase  30.3 
 
 
588 aa  106  6e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2850  histidine kinase  31.62 
 
 
343 aa  106  6e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0497366  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2352  histidine kinase  34.2 
 
 
387 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 
426 aa  103  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.525056  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2820  histidine kinase  34.09 
 
 
265 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0175  histidine kinase  32.13 
 
 
322 aa  99.4  9e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0979792  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0028  histidine kinase  32.95 
 
 
362 aa  98.2  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.801683  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0269  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.13 
 
 
885 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 
562 aa  97.8  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.121796  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 
603 aa  96.7  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 
587 aa  96.7  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0178  histidine kinase  28.81 
 
 
557 aa  96.7  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.283442  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2976  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
732 aa  93.6  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.98148  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
438 aa  93.2  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0919  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 
404 aa  93.2  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000529164 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
689 aa  92  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0715  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 
618 aa  90.9  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1802  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.3 
 
 
572 aa  90.5  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2186  histidine kinase  30.77 
 
 
383 aa  90.5  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0452975  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3664  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 
708 aa  88.6  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 
511 aa  87.8  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0103276  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.29 
 
 
516 aa  84.7  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 
845 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 
845 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
473 aa  83.6  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.753978 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3655  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 
858 aa  82.8  0.000000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 
578 aa  82.8  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 
1309 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0375  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 
450 aa  80.9  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 
483 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2425  membrane bound his kinase A  28.57 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0749883  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0716  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.06 
 
 
890 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0059  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 
729 aa  77  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318391  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0595  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.08 
 
 
473 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 
785 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.830566  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0183  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 
390 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2587  PAS  30.43 
 
 
671 aa  73.6  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187407  normal  0.694957 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1679  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 
760 aa  72.4  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.859765  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2158  histidine kinase  29.33 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.249399  normal  0.778679 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1112  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 
422 aa  70.5  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.46212 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 
1568 aa  70.1  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 
689 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1590  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
447 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1643  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.88 
 
 
739 aa  68.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.85 
 
 
709 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.27 
 
 
1099 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.93 
 
 
1064 aa  67.8  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.19 
 
 
841 aa  66.6  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.73 
 
 
596 aa  66.6  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 
752 aa  66.6  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.43986 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2813  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.37 
 
 
590 aa  66.6  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218828  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3657  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 
478 aa  65.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 
500 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2243  histidine kinase  27.91 
 
 
376 aa  65.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.312206 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.51 
 
 
671 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.918325 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.64 
 
 
1260 aa  65.1  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0318  putative PAS/PAC sensor protein  34.17 
 
 
590 aa  64.3  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375606  normal  0.106516 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3447  ATP-binding region ATPase domain protein  28.68 
 
 
278 aa  63.5  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.733852  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0550  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.32 
 
 
365 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal  0.0432359 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2066  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
370 aa  63.2  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321143  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.01 
 
 
581 aa  62.8  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00493244  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.93 
 
 
875 aa  62  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0257  sensor histidine kinase  25.75 
 
 
340 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5322  histidine kinase sensor  26.37 
 
 
529 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2214  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
480 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 
773 aa  61.6  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.18473  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1029  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 
474 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0979  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
617 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5174  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.84 
 
 
503 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.78 
 
 
903 aa  61.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.644945  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 
515 aa  62  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  22.97 
 
 
368 aa  60.8  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0286  sensor histidine kinase  26.02 
 
 
314 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  25.28 
 
 
1215 aa  61.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0064  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 
564 aa  61.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 
671 aa  61.2  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202041  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1793  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 
591 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.456575  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0316  putative sensor histidine kinase  23.88 
 
 
337 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>