More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2976 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2976  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
732 aa  1456    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.98148  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1762  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 
830 aa  207  6e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0011  putative PAS/PAC sensor protein  41.69 
 
 
781 aa  189  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.206274  normal  0.555511 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
1042 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.755924 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1464  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 
663 aa  167  6.9999999999999995e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 
991 aa  155  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
579 aa  154  7e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.352979  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3337  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
685 aa  154  7e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0421  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 
563 aa  148  4.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.410196  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 
654 aa  147  7.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0851  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 
469 aa  146  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0355773  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1000  histidine kinase  33.13 
 
 
582 aa  144  7e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798946  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3059  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 
493 aa  141  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 
587 aa  140  6e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1570  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
594 aa  139  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138463  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0150  putative PAS/PAC sensor protein  34.52 
 
 
1969 aa  139  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 
603 aa  138  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 
472 aa  138  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.209845  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 
655 aa  137  5e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 
438 aa  137  6.0000000000000005e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
1195 aa  137  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 
1052 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1265  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 
574 aa  131  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1802  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.43 
 
 
572 aa  131  5.0000000000000004e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2051  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 
748 aa  126  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.167205 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 
689 aa  120  7e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.77 
 
 
759 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2820  histidine kinase  38.5 
 
 
265 aa  115  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 
562 aa  115  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.121796  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2652  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.12 
 
 
598 aa  114  6e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2389  histidine kinase  36.67 
 
 
298 aa  114  8.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0317166  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1704  histidine kinase  31.91 
 
 
294 aa  111  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.318661  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.48 
 
 
1291 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1743  histidine kinase  35.27 
 
 
559 aa  110  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0715  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 
618 aa  110  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0919  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
404 aa  109  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000529164 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0178  histidine kinase  38.01 
 
 
557 aa  108  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.283442  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1946  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 
734 aa  106  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0751397  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2850  histidine kinase  34.65 
 
 
343 aa  106  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0497366  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3657  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 
478 aa  105  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.34 
 
 
660 aa  105  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 
768 aa  105  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4104  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.6 
 
 
557 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.8 
 
 
1207 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2969  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.06 
 
 
634 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.163827 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0028  histidine kinase  34.51 
 
 
362 aa  103  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.801683  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0185  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 
691 aa  101  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.483444  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.38 
 
 
743 aa  99.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 
1532 aa  95.9  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  25.27 
 
 
812 aa  96.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.31 
 
 
769 aa  96.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0175  histidine kinase  34.2 
 
 
322 aa  95.1  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0979792  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.4 
 
 
655 aa  94.7  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0515  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 
533 aa  94.7  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  24.69 
 
 
460 aa  94.4  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 
761 aa  93.6  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.04 
 
 
1721 aa  92.8  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3362  PAS sensor protein  27.09 
 
 
678 aa  92  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0253  histidine kinase  27.04 
 
 
588 aa  91.7  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.93 
 
 
813 aa  91.7  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 
1045 aa  91.3  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.48 
 
 
483 aa  91.3  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.03 
 
 
810 aa  90.9  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
1064 aa  90.9  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0692  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.26 
 
 
620 aa  90.9  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  26.54 
 
 
772 aa  90.5  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.69 
 
 
662 aa  90.5  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.12 
 
 
651 aa  90.1  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.57 
 
 
929 aa  90.1  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00773709  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1434  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.41 
 
 
1186 aa  89.4  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  21.92 
 
 
524 aa  89.4  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2042  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 
379 aa  89.7  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.419009  hitchhiker  0.00181161 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.42 
 
 
630 aa  89.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.21488  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 
875 aa  89.4  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2855  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.59 
 
 
712 aa  89.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2845  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.27 
 
 
545 aa  89  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000115656  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2361  two component sensor histidine kinase  24.47 
 
 
827 aa  88.6  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.58 
 
 
1050 aa  88.6  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2024  fused PAS sensor histidine kinase protein and response regulator  25.31 
 
 
1005 aa  88.2  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00627468  normal  0.216163 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2215  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 
810 aa  88.2  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2853  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.03 
 
 
578 aa  88.2  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0212  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.75 
 
 
953 aa  87.4  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.95 
 
 
634 aa  87.4  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.03 
 
 
1060 aa  87.4  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1844  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.4 
 
 
714 aa  87.4  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.257508  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2066  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 
370 aa  86.7  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321143  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.52 
 
 
502 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36757  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.19 
 
 
1069 aa  87  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0414  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  22.15 
 
 
581 aa  87  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3482  putative PAS/PAC sensor protein  30.31 
 
 
994 aa  86.3  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 
351 aa  86.3  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1800  histidine kinase  26.16 
 
 
588 aa  85.9  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0324  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 
464 aa  86.3  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.22 
 
 
852 aa  86.3  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.68 
 
 
608 aa  85.5  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3591  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.97 
 
 
650 aa  85.5  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1146  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  23.75 
 
 
909 aa  85.5  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1320  HD-GYP domain-containing protein  23.95 
 
 
471 aa  85.5  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0267  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.02 
 
 
631 aa  85.9  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.172451  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.41 
 
 
979 aa  85.1  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.366427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>