More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0678 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  100 
 
 		 460 aa  927    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0825  signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 455 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2666  signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 		 446 aa  261  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653198  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 488 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 602 aa  245  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.24 
 
 		 1190 aa  225  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0692  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.74 
 
 		 620 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0218  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 867 aa  212  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269004 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9007  two component sensor kinase  38.15 
 
 		 359 aa  199  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 338 aa  177  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0741  Signal transduction histidine kinase  43.89 
 
 		 498 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 		 372 aa  172  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 		 512 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4605  MCP methyltransferase, CheR-type  39.13 
 
 		 1092 aa  166  9e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315944  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 349 aa  166  9e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 662 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  30.27 
 
 		 1160 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.67 
 
 		 1088 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 725 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 601 aa  160  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 		 850 aa  160  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 409 aa  159  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  31.58 
 
 		 728 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 728 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 907 aa  157  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  38.8 
 
 		 771 aa  155  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  41 
 
 		 840 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  37.6 
 
 		 754 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 571 aa  153  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3370  PAS sensor protein  46.95 
 
 		 713 aa  154  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.277761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 		 583 aa  154  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  33.14 
 
 		 583 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 583 aa  153  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2070  signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 358 aa  152  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.315094  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 489 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 491 aa  150  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 		 733 aa  149  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 352 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2544  Signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 489 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0507  signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 336 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 336 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  42.65 
 
 		 571 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 507 aa  147  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 1027 aa  147  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 		 637 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  32.17 
 
 		 499 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  31.07 
 
 		 1170 aa  146  9e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  31.07 
 
 		 1170 aa  146  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 832 aa  146  9e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  30.84 
 
 		 326 aa  146  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  38.75 
 
 		 872 aa  145  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 336 aa  145  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0630  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.19 
 
 		 699 aa  143  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 1050 aa  143  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3974  signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 635 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0272817 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 		 481 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 1191 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 		 586 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  43.84 
 
 		 588 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 		 713 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 339 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 503 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 344 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  40.93 
 
 		 505 aa  140  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0007  signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 		 482 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.489749  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1146  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  32.26 
 
 		 909 aa  140  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3739  MCP methyltransferase, CheR-type  36.32 
 
 		 1045 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3124  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.42 
 
 		 1374 aa  139  7.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957955  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.37 
 
 		 1167 aa  139  7.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1295  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.02 
 
 		 568 aa  138  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00252669 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  36.49 
 
 		 1165 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 		 639 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 759 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 897 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2895  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 		 705 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3933  signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 		 579 aa  137  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939914  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 304 aa  136  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3364  signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 550 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3297  hypothetical protein  33.79 
 
 		 360 aa  136  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.747205  normal  0.456251 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1811  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.21 
 
 		 1085 aa  136  8e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.532209 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  42.93 
 
 		 577 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  45.89 
 
 		 1676 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 		 488 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3666  signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 550 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123232  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 929 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  26.05 
 
 		 463 aa  134  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 		 677 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 936 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0315  signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 901 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 		 713 aa  134  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  38.39 
 
 		 717 aa  134  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2039  diguanylate cyclase  35.02 
 
 		 432 aa  133  7.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0000319282  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  26.99 
 
 		 945 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0741  signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  40.1 
 
 		 364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  25.81 
 
 		 463 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2030  putative sensor histidine kinase  34.96 
 
 		 313 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>