More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0741 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0741  Signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 498 aa  991    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0249  sensor histidine kinase  31.92 
 
 		 342 aa  186  6e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4605  MCP methyltransferase, CheR-type  40.95 
 
 		 1092 aa  182  9.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315944  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0218  signal transduction histidine kinase  45.41 
 
 		 867 aa  176  8e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  43.89 
 
 		 460 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3739  MCP methyltransferase, CheR-type  43.16 
 
 		 1045 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 512 aa  173  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1602  putative sensor histidine kinase  34.74 
 
 		 311 aa  169  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1655  sensor histidine kinase, putative  34.42 
 
 		 311 aa  167  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716971  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0825  signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 		 455 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4128  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  30.81 
 
 		 663 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1244  signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 336 aa  161  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 547 aa  157  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 503 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 		 545 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 465 aa  155  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1954  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  46.71 
 
 		 468 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.67 
 
 		 882 aa  153  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  43.18 
 
 		 304 aa  151  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 850 aa  151  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5079  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.99 
 
 		 695 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.929766 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0021  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.83 
 
 		 668 aa  150  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0019  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.94 
 
 		 668 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 725 aa  149  9e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2666  signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 		 446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653198  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 582 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.23 
 
 		 708 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 372 aa  148  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  39.73 
 
 		 488 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  32.78 
 
 		 1027 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  41.76 
 
 		 1160 aa  147  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1221  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.75 
 
 		 532 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178023 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 713 aa  146  9e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 929 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2544  Signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 489 aa  144  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3364  signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 		 550 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 728 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 759 aa  143  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  33.83 
 
 		 728 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 571 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 		 352 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 586 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  37.61 
 
 		 872 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  38 
 
 		 849 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  32.88 
 
 		 583 aa  141  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 583 aa  141  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3666  signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 		 550 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123232  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 491 aa  140  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 583 aa  140  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  41.67 
 
 		 1167 aa  139  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1117  PAS sensor protein  30.69 
 
 		 500 aa  139  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  37.07 
 
 		 717 aa  138  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 601 aa  139  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 713 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1267  signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 500 aa  137  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 		 409 aa  137  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 662 aa  136  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 907 aa  136  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 488 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  35.14 
 
 		 842 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  32.62 
 
 		 463 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  32.62 
 
 		 463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1390  signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 		 484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38029 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 489 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 		 559 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  35 
 
 		 733 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 349 aa  133  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 488 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2364  signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 633 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932865  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3027  signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 354 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.452199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3279  signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0171686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  31.65 
 
 		 488 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1297  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.09 
 
 		 1168 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 840 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 639 aa  131  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 		 336 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 930 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 		 338 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 		 588 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3444  signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 572 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753856 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0743  HWE histidine kinase  35.11 
 
 		 483 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 934 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 		 384 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  35.08 
 
 		 930 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0007  signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 482 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.489749  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2070  signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 358 aa  127  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.315094  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 		 1191 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 512 aa  126  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2030  putative sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 313 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  35.5 
 
 		 856 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3313  hypothetical protein  32.52 
 
 		 480 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.29262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6450  signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 635 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 336 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 		 571 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 		 897 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0741  signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 356 aa  125  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 481 aa  124  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3338  hypothetical protein  37.14 
 
 		 333 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal  0.18159 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  29.36 
 
 		 1170 aa  124  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>