245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3279 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3279  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 337 aa  692    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0171686 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3027  signal transduction histidine kinase  94.07 
 
 		 354 aa  658    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.452199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0249  sensor histidine kinase  38.28 
 
 		 342 aa  228  9e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1602  putative sensor histidine kinase  42.58 
 
 		 311 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1655  sensor histidine kinase, putative  42.26 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716971  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1244  signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 		 336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5999  two component sensor kinase  42.35 
 
 		 331 aa  189  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0741  Signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 498 aa  133  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  31.95 
 
 		 1160 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.82 
 
 		 1167 aa  119  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0218  signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 867 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269004 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 662 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 465 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 601 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4605  MCP methyltransferase, CheR-type  28.74 
 
 		 1092 aa  113  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315944  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 500 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  31.13 
 
 		 460 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 725 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 489 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3739  MCP methyltransferase, CheR-type  29.39 
 
 		 1045 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 639 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  31.54 
 
 		 583 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 583 aa  103  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  31.77 
 
 		 856 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0007  signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 482 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.489749  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 571 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 583 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 907 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  30.52 
 
 		 855 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 507 aa  99.8  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0743  HWE histidine kinase  28.31 
 
 		 483 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3313  hypothetical protein  26.42 
 
 		 480 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.29262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  26.61 
 
 		 842 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 346 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 387 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  29.73 
 
 		 872 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  28.89 
 
 		 849 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  25.23 
 
 		 478 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 		 372 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3444  signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 572 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753856 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  29.96 
 
 		 856 aa  93.6  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  31.25 
 
 		 499 aa  93.6  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 488 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 339 aa  92.8  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01099  bacteriophytochrome protein  28.71 
 
 		 822 aa  92.8  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.506628  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0507  signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 336 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  26.83 
 
 		 489 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  29.05 
 
 		 846 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2666  signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 		 446 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653198  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 336 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 586 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 		 384 aa  90.9  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0487  signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 555 aa  90.1  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  29.79 
 
 		 463 aa  90.1  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  29.79 
 
 		 463 aa  89.7  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3933  signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 579 aa  89.7  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939914  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3666  signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 550 aa  89.4  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123232  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0825  signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 455 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3364  signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 550 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2544  Signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 489 aa  87.8  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 341 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  30.41 
 
 		 505 aa  87.8  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 503 aa  87  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 		 559 aa  87  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 346 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1337  signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 		 356 aa  86.3  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3090  signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 		 575 aa  85.1  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0895303  normal  0.0359946 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1628  sensor histidine protein kinase  27.54 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.560713  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 512 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 		 488 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  28 
 
 		 1190 aa  84  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  28.5 
 
 		 488 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 759 aa  83.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  24.15 
 
 		 1027 aa  84  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 713 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  25.7 
 
 		 491 aa  83.6  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3626  signal transduction histidine kinase  25.63 
 
 		 792 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0746201  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 481 aa  82  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7004  signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 552 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0703386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 602 aa  81.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  28.02 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4707  signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 556 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 488 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5586  signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3974  signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 635 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0272817 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1390  signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 		 484 aa  80.1  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 631 aa  79.7  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 577 aa  79.3  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 588 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5599  signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2364  signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 633 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932865  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 850 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 1002 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0950  Signal transduction histidine kinase protein  29.39 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 840 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  26.85 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  27.37 
 
 		 847 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>