269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1655 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1655  sensor histidine kinase, putative  100 
 
 
311 aa  643    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716971  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1602  putative sensor histidine kinase  99.68 
 
 
311 aa  641    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1244  signal transduction histidine kinase  81.67 
 
 
336 aa  536  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0249  sensor histidine kinase  48.73 
 
 
342 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3279  signal transduction histidine kinase  42.26 
 
 
337 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0171686 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3027  signal transduction histidine kinase  41.61 
 
 
354 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.452199  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5999  two component sensor kinase  43.09 
 
 
331 aa  192  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0741  Signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 
498 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4605  MCP methyltransferase, CheR-type  32.38 
 
 
1092 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315944  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.33 
 
 
1167 aa  121  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0218  signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 
867 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269004 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
503 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  34.82 
 
 
460 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  33.78 
 
 
872 aa  119  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
507 aa  119  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
465 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  34.78 
 
 
1160 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
500 aa  115  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 
725 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
586 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
571 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
601 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
759 aa  109  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
512 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0825  signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
455 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2364  signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 
633 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932865  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
489 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 
346 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0743  HWE histidine kinase  32.08 
 
 
483 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  32.26 
 
 
478 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2666  signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 
446 aa  106  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653198  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
372 aa  105  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 
850 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 
662 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4271  histidine kinase  30.38 
 
 
692 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  0.0625064 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
602 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 
488 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2544  Signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
489 aa  102  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3739  MCP methyltransferase, CheR-type  31.25 
 
 
1045 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0007  signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 
482 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.489749  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  32.21 
 
 
326 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
339 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  31.37 
 
 
849 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  34 
 
 
583 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
577 aa  99.8  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  34 
 
 
583 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  27.82 
 
 
488 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 
352 aa  99.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 
582 aa  99  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 
344 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 
349 aa  99  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
336 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0507  signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 
336 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  28.19 
 
 
842 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 
346 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
583 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3666  signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
550 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123232  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
336 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 
488 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3364  signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 
550 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308249  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 
713 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4235  signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 
496 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.942064  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
559 aa  96.7  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3755  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  29.39 
 
 
1063 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  28.26 
 
 
1202 aa  96.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 
304 aa  96.3  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  32.63 
 
 
728 aa  95.9  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
488 aa  95.9  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 
341 aa  95.5  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  30.81 
 
 
1027 aa  95.9  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6264  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  29.06 
 
 
1163 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1153  signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 
275 aa  95.5  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.614752  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 
338 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3626  signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
792 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0746201  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3313  hypothetical protein  31.19 
 
 
480 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.29262 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2182  signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 
528 aa  95.1  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 
907 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
639 aa  94.7  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1213  signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 
603 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
728 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3444  signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 
572 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.753856 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2385  phytochrome:GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:HWE histidine kinase  28.19 
 
 
1003 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.460117  normal  0.215255 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0950  Signal transduction histidine kinase protein  34.31 
 
 
334 aa  93.6  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
387 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0487  signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
555 aa  92.8  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3338  hypothetical protein  30.09 
 
 
333 aa  92.8  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal  0.18159 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 
929 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
631 aa  92  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
1191 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 
409 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  27.08 
 
 
733 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
571 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01099  bacteriophytochrome protein  28.22 
 
 
822 aa  91.3  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.506628  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  33.81 
 
 
364 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  31.02 
 
 
505 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  30.15 
 
 
499 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3974  signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
635 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0272817 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 
481 aa  90.5  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 
840 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  27.69 
 
 
717 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.620506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>