More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2814 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  100 
 
 		 505 aa  1025    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 		 577 aa  226  7e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1377  putative sensor histidine kinase  27.04 
 
 		 561 aa  199  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351027  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  50.48 
 
 		 759 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  45.41 
 
 		 586 aa  180  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  43.54 
 
 		 503 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  44.04 
 
 		 372 aa  170  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 		 488 aa  169  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  46.51 
 
 		 725 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  44.23 
 
 		 713 aa  166  8e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  44.86 
 
 		 840 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  43.43 
 
 		 352 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  46.08 
 
 		 872 aa  162  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 		 339 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 		 387 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 571 aa  160  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 		 409 aa  160  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  44.08 
 
 		 850 aa  160  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 		 713 aa  159  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  43.75 
 
 		 717 aa  159  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  43.4 
 
 		 1160 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 		 571 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 		 907 aa  156  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 		 488 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  40.1 
 
 		 488 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 		 489 aa  154  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  42.66 
 
 		 488 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  43.18 
 
 		 349 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 		 341 aa  151  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 465 aa  150  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  43.48 
 
 		 1167 aa  150  7e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  43.81 
 
 		 588 aa  150  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  43.35 
 
 		 897 aa  149  9e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 491 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  40.31 
 
 		 338 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5589  sensor histidine kinase  25.54 
 
 		 632 aa  147  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 		 583 aa  147  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0615  signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 		 258 aa  147  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 930 aa  147  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 		 583 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  42.03 
 
 		 662 aa  146  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  40.1 
 
 		 583 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  42.36 
 
 		 1016 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  42.03 
 
 		 601 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  40.18 
 
 		 1190 aa  145  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  42.29 
 
 		 481 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  39.55 
 
 		 930 aa  145  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 934 aa  144  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 		 344 aa  144  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  41.92 
 
 		 1041 aa  144  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 		 559 aa  144  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 		 304 aa  143  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  43.88 
 
 		 500 aa  143  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  34.06 
 
 		 463 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  34.06 
 
 		 463 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  42.21 
 
 		 384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 		 631 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2385  phytochrome:GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:HWE histidine kinase  41.88 
 
 		 1003 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.460117  normal  0.215255 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1337  signal transduction histidine kinase  39.61 
 
 		 356 aa  141  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  40.31 
 
 		 346 aa  141  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  43.23 
 
 		 1001 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 		 677 aa  140  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 		 1002 aa  140  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  40.93 
 
 		 460 aa  140  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 346 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3090  signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 		 575 aa  139  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0895303  normal  0.0359946 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1551  signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 642 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518292 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4826  signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 553 aa  139  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788722  normal  0.27838 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0315  signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 		 901 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  42.55 
 
 		 738 aa  137  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 507 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0950  Signal transduction histidine kinase protein  39.59 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3264  HWE histidine kinase  39.6 
 
 		 261 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440778 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  42.08 
 
 		 733 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 		 602 aa  134  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1153  signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 275 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.614752  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  37.81 
 
 		 499 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  39.8 
 
 		 364 aa  134  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  40.64 
 
 		 512 aa  134  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  42.93 
 
 		 582 aa  134  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1390  signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 		 484 aa  133  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38029 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  41.54 
 
 		 478 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 639 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1628  sensor histidine protein kinase  37.86 
 
 		 332 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.560713  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  38.46 
 
 		 852 aa  130  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3933  signal transduction histidine kinase  25.8 
 
 		 579 aa  130  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939914  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2544  Signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 489 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2160  signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 263 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.31354  normal  0.0264622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2176  putative signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0743  HWE histidine kinase  40 
 
 		 483 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 489 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1635  signal transduction histidine kinase  41.71 
 
 		 362 aa  127  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.466466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 929 aa  127  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  35.78 
 
 		 1027 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4618  signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 454 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723174  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3313  hypothetical protein  39.18 
 
 		 480 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.29262 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2666  signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 446 aa  125  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653198  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  37.04 
 
 		 842 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3666  signal transduction histidine kinase  24.65 
 
 		 550 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123232  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5005  signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 		 334 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>