More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1628 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1628  sensor histidine protein kinase  100 
 
 		 332 aa  675    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.560713  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3338  hypothetical protein  67.78 
 
 		 333 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal  0.18159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5005  signal transduction histidine kinase  49.54 
 
 		 334 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6624  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4106  signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 453 aa  150  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0707076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 465 aa  149  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  34.98 
 
 		 478 aa  149  9e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2752  Signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 		 374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.25637  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 		 409 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2534  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 356 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  34.18 
 
 		 1160 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 352 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 725 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 489 aa  143  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  30.06 
 
 		 1027 aa  143  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  35.53 
 
 		 583 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 583 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1476  signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 357 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0180149 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1063  signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 358 aa  140  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0212102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 583 aa  140  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 		 577 aa  139  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3313  hypothetical protein  32.34 
 
 		 480 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.29262 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 713 aa  138  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  39.63 
 
 		 846 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 571 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 		 372 aa  136  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 586 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 503 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 		 588 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.89 
 
 		 1167 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  40.69 
 
 		 341 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1636  two component sensor kinase  30.54 
 
 		 342 aa  131  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264656  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  36 
 
 		 844 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  37.86 
 
 		 505 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0007  signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 482 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.489749  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  39.25 
 
 		 717 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 		 713 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6722  signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 364 aa  129  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.16203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 601 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 759 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 850 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 840 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 662 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0218  signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 		 867 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269004 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  34.98 
 
 		 733 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1337  signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 356 aa  127  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6211  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.28 
 
 		 1061 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820077  normal  0.703655 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 571 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4618  signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 454 aa  126  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723174  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 		 1165 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  35.51 
 
 		 856 aa  126  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  35.61 
 
 		 844 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  34.86 
 
 		 842 aa  125  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3666  signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 550 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123232  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 		 488 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 929 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 488 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 602 aa  123  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3264  HWE histidine kinase  32.37 
 
 		 261 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440778 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 384 aa  122  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  35.32 
 
 		 499 aa  122  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 907 aa  122  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  35.45 
 
 		 1170 aa  122  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  33.65 
 
 		 872 aa  122  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0743  HWE histidine kinase  31.2 
 
 		 483 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  35.45 
 
 		 1170 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  34.74 
 
 		 849 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  34.27 
 
 		 847 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3416  signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 413 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813211  normal  0.0120926 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  34.88 
 
 		 855 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 491 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 		 481 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  34.27 
 
 		 847 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4311  signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.801495  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3364  signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 550 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0615  signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 258 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  29.39 
 
 		 488 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  30.72 
 
 		 460 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 488 aa  119  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2030  putative sensor histidine kinase  35.55 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2544  Signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 489 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4826  signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 553 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788722  normal  0.27838 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3755  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.6 
 
 		 1063 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 559 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  33.8 
 
 		 847 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.38 
 
 		 676 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00629905  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 507 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0741  signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 		 356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 512 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0180  signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 380 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012775  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  34.33 
 
 		 852 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 500 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0741  Signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 498 aa  116  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0950  Signal transduction histidine kinase protein  27.78 
 
 		 334 aa  116  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 346 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01099  bacteriophytochrome protein  36.14 
 
 		 822 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.506628  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 		 738 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>