More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1063 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1063  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 358 aa  724    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0212102 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1476  signal transduction histidine kinase  65.36 
 
 		 357 aa  434  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0180149 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2534  signal transduction histidine kinase  54.68 
 
 		 356 aa  380  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2752  Signal transduction histidine kinase  50.58 
 
 		 374 aa  316  4e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.25637  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6722  signal transduction histidine kinase  45.24 
 
 		 364 aa  299  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.16203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  42.14 
 
 		 391 aa  259  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2946  signal transduction histidine kinase  41.99 
 
 		 349 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.341682  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0772  signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 		 371 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3762  signal transduction histidine kinase  39.7 
 
 		 353 aa  224  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4106  signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 453 aa  186  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0707076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1636  two component sensor kinase  31.98 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264656  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3338  hypothetical protein  31.02 
 
 		 333 aa  146  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal  0.18159 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1628  sensor histidine protein kinase  31.49 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.560713  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0327  putative PAS/PAC sensor protein  52.59 
 
 		 1008 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 1714 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5005  signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6624  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 387 aa  122  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.01 
 
 		 676 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00629905  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  32.56 
 
 		 744 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 815 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2460  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  48.74 
 
 		 971 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.93 
 
 		 1668 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 361 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 362 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 1654 aa  116  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 349 aa  116  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  34.21 
 
 		 344 aa  116  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 613 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.93 
 
 		 1663 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2313  Fis family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 510 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 362 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  31.14 
 
 		 1239 aa  113  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 398 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  27.2 
 
 		 1407 aa  112  7.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  29.41 
 
 		 1399 aa  112  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  33.19 
 
 		 348 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5952  signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 752 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  45.6 
 
 		 650 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 382 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 871 aa  110  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 		 3706 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 348 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 406 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 1390 aa  108  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 746 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 681 aa  108  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0148  Signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.332902  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1781  signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 		 572 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 362 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 771 aa  106  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 382 aa  106  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2279  signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 392 aa  105  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 874 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  32.37 
 
 		 649 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 991 aa  105  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1343  signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.54395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 381 aa  104  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3102  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  43.2 
 
 		 1418 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 1560 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 1183 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 771 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 488 aa  103  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 439 aa  103  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 1253 aa  103  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 551 aa  103  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 764 aa  102  8e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  32.14 
 
 		 624 aa  102  8e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 875 aa  102  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 400 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  33 
 
 		 895 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 2693 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0664  Signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 945 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 		 215 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 864 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 461 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 872 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  32.11 
 
 		 783 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 465 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 909 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  26.73 
 
 		 547 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 532 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 526 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1989  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  45.13 
 
 		 1110 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175442  normal  0.013335 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 878 aa  100  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 732 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 1093 aa  99.8  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 834 aa  99.4  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1518  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.85 
 
 		 769 aa  99.4  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2165  signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 358 aa  99.4  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 964 aa  99.4  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 767 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 1093 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>