More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0298 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 349 aa  681    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  77.3 
 
 		 348 aa  528  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  79.35 
 
 		 354 aa  528  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  78.45 
 
 		 348 aa  522  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  78.74 
 
 		 348 aa  523  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2424  signal transduction histidine kinase  53.01 
 
 		 354 aa  341  9e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2165  signal transduction histidine kinase  54.01 
 
 		 358 aa  339  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0664  Signal transduction histidine kinase  57.1 
 
 		 344 aa  332  6e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  49.3 
 
 		 361 aa  315  9e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  49.42 
 
 		 360 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  48.17 
 
 		 363 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  46.51 
 
 		 362 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  48.01 
 
 		 362 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  46.4 
 
 		 362 aa  298  8e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  48.26 
 
 		 362 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  48.37 
 
 		 344 aa  291  8e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5952  signal transduction histidine kinase  52.46 
 
 		 355 aa  286  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2333  signal transduction histidine kinase  48.74 
 
 		 376 aa  238  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0148  Signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.332902  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1781  signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1343  signal transduction histidine kinase  43.47 
 
 		 350 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.54395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 406 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 416 aa  136  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 381 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 		 382 aa  129  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 613 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 1093 aa  126  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  37.9 
 
 		 381 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  39.21 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 381 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 1654 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  30.71 
 
 		 783 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 3706 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3834  signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 578 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.391649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 1093 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 1093 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 1676 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1560 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 864 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 		 532 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 771 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0050  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.52 
 
 		 440 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4555  signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 		 369 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1063  signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 358 aa  116  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0212102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1894  PAS sensor protein  33.33 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 945 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 648 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_004310  BR1659  sensor histidine kinase  32.47 
 
 		 476 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 215 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1607  sensor histidine kinase  32.49 
 
 		 437 aa  113  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.59 
 
 		 895 aa  113  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 875 aa  113  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 547 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 732 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 		 941 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  30.29 
 
 		 744 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1670  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261958  normal  0.184327 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 991 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 721 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0911916  normal  0.976086 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2024  signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 		 497 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  0.406004 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 871 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 739 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 439 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 465 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 1714 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6069  signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 		 659 aa  109  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 462 aa  109  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 874 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 		 2693 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  28.84 
 
 		 1239 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 767 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1476  signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 		 357 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0180149 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0327  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  32.8 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0659976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 764 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 572 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 771 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 524 aa  106  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  35.47 
 
 		 391 aa  106  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 681 aa  106  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2279  signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 392 aa  106  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 400 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 		 545 aa  106  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 431 aa  106  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2752  Signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 374 aa  105  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.25637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0054  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.43 
 
 		 467 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0498  signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3686  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 709 aa  105  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206553 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 872 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 		 1390 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3288  Signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 662 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390564  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 461 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 398 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 1246 aa  104  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 1253 aa  104  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2534  sensory box/response regulator  42.14 
 
 		 452 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 488 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1249  signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 815 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0255  sensor histidine kinase  30.21 
 
 		 480 aa  102  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>