More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2024 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2024  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 497 aa  990    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  0.406004 
 
 
-
 
NC_004310  BR1659  sensor histidine kinase  34.14 
 
 		 476 aa  249  9e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1607  sensor histidine kinase  34.98 
 
 		 437 aa  241  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1249  signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 		 460 aa  237  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0255  sensor histidine kinase  41.33 
 
 		 480 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0666  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 579 aa  121  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.74861  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 		 349 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 361 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2335  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 504 aa  107  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0664  Signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 344 aa  106  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3208  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.25 
 
 		 622 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0750823 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 362 aa  105  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0150  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 		 494 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0585  sensor histidine kinase/response regulator  35.85 
 
 		 494 aa  104  3e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.785291 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1783  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 		 494 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.992798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 348 aa  103  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 		 354 aa  103  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 360 aa  103  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  37.95 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 363 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 		 348 aa  102  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 362 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 362 aa  100  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 1093 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 547 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 362 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  31.72 
 
 		 344 aa  98.2  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 526 aa  97.8  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 681 aa  97.1  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 1676 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0148  Signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 350 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.332902  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 347 aa  95.5  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1781  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 350 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5952  signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 355 aa  95.1  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4519  signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 366 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175783  normal  0.446714 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 		 510 aa  94.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2397  signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 493 aa  94  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  hitchhiker  0.00117344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 1560 aa  93.2  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 		 991 aa  93.2  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4407  signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 366 aa  92  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.993369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4037  PAS sensor protein  33.05 
 
 		 366 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2609  signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 492 aa  91.7  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 732 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 945 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1343  signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 350 aa  91.3  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.54395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3478  putative signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 354 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 746 aa  90.1  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.31 
 
 		 510 aa  90.1  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54369  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0386  two component sensor kinase  24.21 
 
 		 495 aa  89.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0712602  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 872 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 545 aa  89.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0765  signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 495 aa  88.2  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0891628  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4553  signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 		 351 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4182  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.35 
 
 		 338 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.55 
 
 		 510 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.475252  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0623  signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 334 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.528714 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 215 aa  87.8  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2870  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.75 
 
 		 510 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267269  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 406 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3280  PAS sensor protein  32.16 
 
 		 354 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2424  signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 354 aa  87  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2165  signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 358 aa  86.7  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 1093 aa  86.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.46 
 
 		 1145 aa  86.7  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 532 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2698  signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 489 aa  86.3  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112913  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 416 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1116  hypothetical protein  29.03 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  29 
 
 		 744 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2752  Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.25637  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  30.98 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1884  signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 484 aa  85.1  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.857043 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 		 832 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 3706 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 1093 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2753  signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 674 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3604  signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 603 aa  85.1  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 1654 aa  84.7  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 767 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 		 739 aa  84.7  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  25.77 
 
 		 1390 aa  84.3  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 771 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 382 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 551 aa  84  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08440  signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 492 aa  83.6  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.367535  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2279  signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  25.46 
 
 		 437 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3288  Signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 662 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390564  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  28.57 
 
 		 1196 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3796  signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 500 aa  83.2  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4218  adenylate/guanylate cyclase  31.65 
 
 		 468 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.79 
 
 		 1195 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 		 1253 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 732 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 		 506 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>