More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3288 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3288  Signal transduction histidine kinase  100 
 
 
662 aa  1299    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390564  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0092  signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
570 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0277499 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2023  signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
596 aa  180  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.175935  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2700  signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 
592 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1271  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 
593 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2929  signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
593 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 
603 aa  148  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2819  signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
597 aa  145  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.753757 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 
815 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3834  signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 
578 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.391649  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
964 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 
215 aa  124  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 
878 aa  124  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
1654 aa  124  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  33.88 
 
 
744 aa  124  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 
3706 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 
839 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  34.29 
 
 
783 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 
912 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3564  signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 
594 aa  117  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.186387  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  29.1 
 
 
682 aa  117  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
991 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
790 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 
545 aa  116  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 
752 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0051  signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 
585 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.725839 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 
1093 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 
674 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
932 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 
382 aa  115  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 
757 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 
1093 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
526 aa  114  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
771 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
1253 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0116  signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 
698 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 
439 aa  113  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 
488 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4695  signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 
364 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  0.12529 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
872 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 
1183 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 
732 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  29.75 
 
 
1210 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  26.04 
 
 
754 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 
437 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
382 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
813 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2724  signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 
613 aa  111  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.524296  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 
613 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 
774 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 
771 aa  111  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  27.98 
 
 
1182 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 
1560 aa  110  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
732 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 
834 aa  110  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
1390 aa  109  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 
782 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  30.13 
 
 
892 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.43 
 
 
1663 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  27.38 
 
 
704 aa  107  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 
945 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 
547 aa  107  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
913 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 
739 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 
349 aa  106  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6532  signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
368 aa  106  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0793858  normal  0.366363 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.55 
 
 
1668 aa  106  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
387 aa  106  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 
1051 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  26.49 
 
 
1714 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 
749 aa  106  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 
572 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 
767 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
1676 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 
354 aa  106  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
585 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1343  signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 
350 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.54395  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  25.96 
 
 
1248 aa  104  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0148  Signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 
350 aa  105  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.332902  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
657 aa  104  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1781  signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 
350 aa  105  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
864 aa  104  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 
347 aa  104  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  25.78 
 
 
918 aa  104  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 
832 aa  104  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08676  hypothetical protein  28 
 
 
650 aa  104  6e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0972974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 
746 aa  104  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 
681 aa  104  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  27.78 
 
 
1239 aa  103  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
406 aa  103  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
532 aa  103  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  27.95 
 
 
676 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  27.27 
 
 
945 aa  102  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 
693 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
381 aa  102  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  33.33 
 
 
344 aa  102  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 
462 aa  102  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  28.22 
 
 
657 aa  101  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  29.23 
 
 
800 aa  100  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
941 aa  100  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>