More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1628 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 431 aa  863    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  53.62 
 
 		 400 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  55.39 
 
 		 408 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0327  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  51.61 
 
 		 400 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0659976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0498  signal transduction histidine kinase  50.27 
 
 		 420 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3529  signal transduction histidine kinase  50.39 
 
 		 405 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2279  signal transduction histidine kinase  44.09 
 
 		 392 aa  296  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  44.36 
 
 		 398 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  44.78 
 
 		 381 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  44.9 
 
 		 381 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  44.47 
 
 		 382 aa  281  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  45.73 
 
 		 381 aa  278  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  42.63 
 
 		 406 aa  274  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  41.22 
 
 		 414 aa  254  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 		 416 aa  249  6e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  42.29 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 		 461 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0693  Signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  44.06 
 
 		 739 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 387 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 		 551 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 526 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  36.77 
 
 		 744 aa  127  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  35.21 
 
 		 1239 aa  126  9e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 1676 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 1093 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 767 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 354 aa  123  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 1093 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 3706 aa  123  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 771 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 732 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1560 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  37.5 
 
 		 348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 		 348 aa  121  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 348 aa  121  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 347 aa  120  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 746 aa  119  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 1253 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 613 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 		 362 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 		 1177 aa  117  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 909 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 739 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 945 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 2693 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 1051 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 488 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 1654 aa  113  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 941 aa  113  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  34.56 
 
 		 783 aa  113  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 547 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 363 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 747 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.17 
 
 		 1668 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 721 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0911916  normal  0.976086 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5177  signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 749 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 361 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 		 871 aa  111  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 790 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 1390 aa  110  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 924 aa  110  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 362 aa  110  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 360 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 674 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 788 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 681 aa  108  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 545 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 572 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 603 aa  109  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 991 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 815 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 964 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 913 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1210 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  33.33 
 
 		 1663 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3760  signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 		 511 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 585 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 1714 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 382 aa  107  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 349 aa  106  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4182  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  33.46 
 
 		 338 aa  106  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4553  signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 351 aa  106  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 932 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 648 aa  106  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 752 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 864 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 1227 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 764 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 771 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 682 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 874 aa  103  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 693 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 		 875 aa  103  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 856 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 1051 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1712  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  36.45 
 
 		 491 aa  103  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>