More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0693 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0693  Signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 400 aa  820    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0366  GAF sensor hybrid histidine kinase  60.66 
 
 		 618 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 		 416 aa  232  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 406 aa  222  9e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.03 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 414 aa  192  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3529  signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 405 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0327  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  34.84 
 
 		 400 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0659976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0498  signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 420 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 400 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 408 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 		 398 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2279  signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 392 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 545 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35 
 
 		 895 aa  110  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 875 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4126  signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 874 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 603 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 864 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.65 
 
 		 1663 aa  103  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  28.92 
 
 		 1668 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 639 aa  101  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 871 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1636  two component sensor kinase  29.22 
 
 		 342 aa  99.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264656  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 1253 aa  99  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 347 aa  98.6  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1229  two component LuxR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 502 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 788 aa  98.2  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 465 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6046  two component LuxR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 502 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 461 aa  96.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 1654 aa  96.7  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3214  ABC-2 type transporter  32.4 
 
 		 540 aa  96.7  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 1560 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 382 aa  95.9  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 462 aa  95.9  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 704 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4116  putative PAS/PAC sensor protein  31.38 
 
 		 982 aa  95.5  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.147835  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0970  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 		 729 aa  94  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 1714 aa  93.6  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 387 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  31.46 
 
 		 391 aa  93.2  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6450  signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 635 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 681 aa  92.8  8e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 964 aa  92.8  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  29.35 
 
 		 1182 aa  92.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 1093 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 839 aa  92.4  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 532 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3963  signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 538 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3225  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 541 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2857  signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 515 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207944  normal  0.114386 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 674 aa  91.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 439 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  31.78 
 
 		 783 aa  92  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4106  signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 453 aa  92  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0707076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4272  putative PAS/PAC sensor protein  32 
 
 		 919 aa  92  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.312579  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 1676 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1894  PAS sensor protein  29.96 
 
 		 387 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 1093 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  29.63 
 
 		 754 aa  90.5  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0270  putative PAS/PAC sensor protein  31.18 
 
 		 630 aa  89.7  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 648 aa  89.7  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 682 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 		 2693 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 771 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 815 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6532  signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 368 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0793858  normal  0.366363 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 872 aa  89  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 909 aa  88.2  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1678  signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 348 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293126  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4695  signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 364 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  0.12529 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 		 613 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 1246 aa  87.8  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 526 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  28.77 
 
 		 449 aa  87.4  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4182  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.24 
 
 		 338 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  31 
 
 		 1239 aa  87.4  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 488 aa  87.4  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4553  signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 351 aa  87  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 3706 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2534  signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 356 aa  87  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 832 aa  86.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 547 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2228  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 654 aa  86.3  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1476  signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 357 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0180149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 492 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  30.05 
 
 		 744 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 834 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1063  signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 358 aa  85.9  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0212102 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 941 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 771 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 878 aa  84.7  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1806  putative two-component sensor histidine kinase  31.33 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6722  signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.16203  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>