More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4408 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 408 aa  820    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  66.23 
 
 		 400 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0498  signal transduction histidine kinase  60.53 
 
 		 420 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0327  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  60.42 
 
 		 400 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0659976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3529  signal transduction histidine kinase  56.92 
 
 		 405 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  55.53 
 
 		 431 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  50.13 
 
 		 398 aa  347  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2279  signal transduction histidine kinase  49.61 
 
 		 392 aa  347  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  50.78 
 
 		 382 aa  345  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  48.82 
 
 		 381 aa  338  7e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  49.34 
 
 		 381 aa  338  8e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  48.56 
 
 		 381 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  48.31 
 
 		 406 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  47.64 
 
 		 416 aa  319  7e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  48.07 
 
 		 414 aa  310  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  46.77 
 
 		 461 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 465 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0693  Signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 400 aa  160  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  46.01 
 
 		 739 aa  149  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 1560 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  31.25 
 
 		 744 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 1093 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 1093 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  34.48 
 
 		 783 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 		 551 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 1654 aa  126  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 		 732 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 1390 aa  125  9e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 526 aa  125  9e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 771 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2857  signal transduction histidine kinase  41.85 
 
 		 515 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207944  normal  0.114386 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 941 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 3706 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 739 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 872 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 1714 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 1051 aa  119  9e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 913 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  33.87 
 
 		 1663 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 746 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 362 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 767 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 382 aa  116  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 1676 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 387 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 909 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 771 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  33.21 
 
 		 1668 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 681 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1177 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 815 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 572 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  32.86 
 
 		 1239 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 764 aa  114  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7100  signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 		 357 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 488 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 613 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 752 aa  113  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 		 723 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 945 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 362 aa  113  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 532 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 912 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 2693 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 362 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1712  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  35.5 
 
 		 491 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3695  signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 503 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316743  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3760  signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 511 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 215 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 757 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 782 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 874 aa  111  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 		 980 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 991 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0555  signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 521 aa  110  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2909  signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 		 487 aa  110  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.422924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 545 aa  110  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 547 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4106  signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 		 453 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0707076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0970  signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 520 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183244  normal  0.273355 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0366  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.38 
 
 		 618 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 1227 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 1051 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5177  signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 		 492 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 790 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 871 aa  107  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 875 aa  107  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 747 aa  107  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 1253 aa  107  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2698  signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 		 489 aa  106  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112913  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 603 aa  106  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.02 
 
 		 895 aa  106  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 964 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6532  signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 368 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0793858  normal  0.366363 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 437 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 1246 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 924 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>