More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2857 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2857  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 515 aa  1053    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207944  normal  0.114386 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  47.47 
 
 		 406 aa  160  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  42.93 
 
 		 416 aa  155  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 		 382 aa  150  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  47.47 
 
 		 414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  44.94 
 
 		 381 aa  144  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  44.94 
 
 		 381 aa  143  8e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  44.94 
 
 		 381 aa  143  9e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3529  signal transduction histidine kinase  44.77 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0498  signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 		 420 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  43.96 
 
 		 400 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0327  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  42.46 
 
 		 400 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0659976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 639 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 		 362 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 3706 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4116  putative PAS/PAC sensor protein  29.9 
 
 		 982 aa  120  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.147835  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 1532 aa  118  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 613 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 339 aa  116  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 361 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 		 362 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  41.24 
 
 		 408 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 834 aa  114  6e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1229  two component LuxR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 502 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 		 681 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 362 aa  111  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 		 642 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 360 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  32.07 
 
 		 783 aa  109  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0585  sensor histidine kinase/response regulator  38.16 
 
 		 494 aa  108  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.785291 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 551 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 		 526 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 461 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 		 1714 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 363 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 		 439 aa  105  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 572 aa  104  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 631 aa  103  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  30.74 
 
 		 744 aa  102  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 674 aa  101  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 1676 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 1177 aa  101  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0366  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 		 618 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 864 aa  100  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6046  two component LuxR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 502 aa  100  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 2693 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0765  signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 495 aa  100  8e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0891628  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 793 aa  100  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 532 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  26.33 
 
 		 892 aa  98.6  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 354 aa  99  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5952  signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 355 aa  99  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0270  putative PAS/PAC sensor protein  26.07 
 
 		 630 aa  98.6  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2333  signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 376 aa  97.8  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 		 472 aa  97.4  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0315  signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 901 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 547 aa  97.4  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 932 aa  97.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 674 aa  96.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0136  diguanylate cyclase  36.11 
 
 		 1428 aa  96.7  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 1093 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 767 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 1183 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2424  signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 354 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 980 aa  96.7  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0559  signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 490 aa  96.3  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 1390 aa  96.3  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 387 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08440  signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 492 aa  95.5  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.367535  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 		 878 aa  95.5  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.52 
 
 		 348 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2165  signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 358 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  25.96 
 
 		 913 aa  95.1  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  30.25 
 
 		 657 aa  95.1  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 732 aa  95.1  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 1093 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2829  signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 517 aa  95.1  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  23.31 
 
 		 657 aa  95.1  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 348 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 348 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  25.95 
 
 		 886 aa  94.4  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2397  signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 493 aa  94.7  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  hitchhiker  0.00117344 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  25.65 
 
 		 764 aa  94.4  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 912 aa  93.6  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 349 aa  94  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 465 aa  94  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  40 
 
 		 344 aa  93.6  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 1253 aa  93.6  8e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 347 aa  93.6  8e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 1654 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0664  Signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 		 344 aa  92.8  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 788 aa  92.8  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1884  signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 484 aa  92.4  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.857043 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0970  signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 520 aa  92.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183244  normal  0.273355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5252  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.29 
 
 		 1698 aa  92.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2228  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 654 aa  92.4  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1809  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.96 
 
 		 927 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 871 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 		 964 aa  92.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>