More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0970 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3760  signal transduction histidine kinase  91.09 
 
 		 511 aa  890    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0970  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 520 aa  1020    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183244  normal  0.273355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8307  putative signal transduction histidine kinase  53.75 
 
 		 497 aa  478  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3695  signal transduction histidine kinase  53.01 
 
 		 503 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316743  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0559  signal transduction histidine kinase  55.67 
 
 		 490 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0555  signal transduction histidine kinase  50.1 
 
 		 521 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3696  signal transduction histidine kinase  49.8 
 
 		 514 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4087  signal transduction histidine kinase  52.71 
 
 		 508 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0238732  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2909  signal transduction histidine kinase  52.83 
 
 		 487 aa  436  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.422924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5177  signal transduction histidine kinase  51.3 
 
 		 492 aa  433  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7712  signal transduction histidine kinase  52.21 
 
 		 509 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3706  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  51.95 
 
 		 516 aa  426  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6290  signal transduction histidine kinase  51.61 
 
 		 492 aa  424  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1712  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  49.4 
 
 		 491 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30710  signal transduction histidine kinase  48.36 
 
 		 512 aa  415  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.523604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4185  signal transduction histidine kinase  52.17 
 
 		 494 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1382  signal transduction histidine kinase  46.79 
 
 		 496 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1400  signal transduction histidine kinase  46.79 
 
 		 496 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1411  signal transduction histidine kinase  45.54 
 
 		 500 aa  387  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.597292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1109  signal transduction histidine kinase  47.63 
 
 		 501 aa  388  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.366346  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1416  signal transduction histidine kinase  46.79 
 
 		 496 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3796  signal transduction histidine kinase  48.1 
 
 		 500 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1781  signal transduction histidine kinase  45.69 
 
 		 496 aa  374  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525963 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4686  signal transduction histidine kinase  46.18 
 
 		 496 aa  375  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0201363  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2609  signal transduction histidine kinase  46.34 
 
 		 492 aa  362  1e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2397  signal transduction histidine kinase  46.77 
 
 		 493 aa  360  4e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  hitchhiker  0.00117344 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13246  two component sensor kinase  44.6 
 
 		 501 aa  359  8e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.467519 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3522  histidine kinase dimerization/phosphoacceptor  45.58 
 
 		 500 aa  358  9.999999999999999e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2829  signal transduction histidine kinase  45.79 
 
 		 517 aa  355  8.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08440  signal transduction histidine kinase  44.92 
 
 		 492 aa  348  2e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.367535  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1884  signal transduction histidine kinase  43.17 
 
 		 484 aa  345  1e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.857043 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2429  signal transduction histidine kinase  43.11 
 
 		 490 aa  339  7e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180787 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2698  signal transduction histidine kinase  44.02 
 
 		 489 aa  335  9e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112913  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0585  sensor histidine kinase/response regulator  38 
 
 		 494 aa  296  6e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.785291 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0765  signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 		 495 aa  286  8e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0891628  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14630  signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 		 502 aa  273  4.0000000000000004e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20510  signal transduction histidine kinase  38.51 
 
 		 497 aa  249  7e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101775  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08780  signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 		 480 aa  239  9e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102396  normal  0.0847778 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0352  signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 475 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1292  signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 492 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1052  signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 465 aa  169  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0083  signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 		 470 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1075  signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 478 aa  162  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0889  sensor histidine kinase  25.25 
 
 		 475 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  36.65 
 
 		 744 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 1093 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 		 613 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 1093 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 215 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  35.1 
 
 		 1239 aa  114  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  30.94 
 
 		 918 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  31.18 
 
 		 1248 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 991 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 681 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 941 aa  111  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 1654 aa  111  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  31.78 
 
 		 754 aa  110  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 878 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 408 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  35.95 
 
 		 783 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 945 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 572 aa  108  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 		 732 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 347 aa  107  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 1253 aa  107  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 2693 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  29.88 
 
 		 682 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 1390 aa  105  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 3706 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 834 aa  103  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 727 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 924 aa  103  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 1227 aa  102  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 815 aa  101  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 657 aa  100  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 431 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 1183 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2279  signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 392 aa  100  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0498  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 420 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 439 aa  99.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 462 aa  99.8  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 945 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.93 
 
 		 1663 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3529  signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 405 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 704 aa  98.2  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 488 aa  98.6  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 819 aa  97.8  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  29.21 
 
 		 936 aa  97.8  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  30.24 
 
 		 1210 aa  97.8  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3724  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 358 aa  97.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3458  signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 358 aa  97.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 1676 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3812  signal transduction histidine kinase  38.42 
 
 		 334 aa  97.1  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.255567  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 767 aa  97.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 764 aa  96.7  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 1051 aa  96.7  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 382 aa  96.7  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2753  signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 325 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 674 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>