More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5358 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  99.71 
 
 		 348 aa  687    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 348 aa  688    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  89.34 
 
 		 348 aa  608  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  81.87 
 
 		 354 aa  554  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  78.74 
 
 		 349 aa  536  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2165  signal transduction histidine kinase  52.06 
 
 		 358 aa  333  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2424  signal transduction histidine kinase  51.76 
 
 		 354 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0664  Signal transduction histidine kinase  55.59 
 
 		 344 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  46.84 
 
 		 360 aa  295  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  46.33 
 
 		 363 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  46.57 
 
 		 361 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  45.48 
 
 		 362 aa  288  7e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  44.06 
 
 		 362 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  44.54 
 
 		 362 aa  281  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  46.88 
 
 		 344 aa  281  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5952  signal transduction histidine kinase  49.57 
 
 		 355 aa  277  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  44.77 
 
 		 362 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2333  signal transduction histidine kinase  46.37 
 
 		 376 aa  232  9e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0148  Signal transduction histidine kinase  42.82 
 
 		 350 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.332902  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1781  signal transduction histidine kinase  42.82 
 
 		 350 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1343  signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 		 350 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.54395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  40.69 
 
 		 406 aa  143  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 		 382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 1093 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 		 381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 1093 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 1093 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 1654 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  37.55 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 721 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0911916  normal  0.976086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 381 aa  124  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 3706 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 		 532 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 431 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.42 
 
 		 864 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 414 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  37.71 
 
 		 895 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 613 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 		 875 aa  119  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 603 aa  119  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 400 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 547 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0050  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.07 
 
 		 440 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4555  signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 		 369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 874 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 871 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 1560 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2279  signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 392 aa  116  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 215 aa  116  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1670  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.55 
 
 		 394 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261958  normal  0.184327 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 382 aa  115  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0327  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  35.62 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0659976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3686  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 		 709 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 767 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 771 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  32.22 
 
 		 744 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 648 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0054  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.82 
 
 		 467 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1659  sensor histidine kinase  30.42 
 
 		 476 aa  113  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 398 aa  113  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 488 aa  112  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 439 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1607  sensor histidine kinase  30.42 
 
 		 437 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 732 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1894  PAS sensor protein  38.33 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  28.35 
 
 		 783 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 1676 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1063  signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0212102 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 461 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 681 aa  110  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 945 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 941 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1538  signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 232 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  29.44 
 
 		 1239 aa  109  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6069  signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 659 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 739 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 524 aa  107  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 1714 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 991 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 465 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3834  signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 578 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.391649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  35.71 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 872 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1636  two component sensor kinase  32.84 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264656  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 462 aa  107  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2819  signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 		 597 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.753757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 747 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 739 aa  106  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1476  signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 357 aa  106  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0180149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4364  signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 807 aa  106  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.217771 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0498  signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 420 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2752  Signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 374 aa  105  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.25637  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 771 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 		 2693 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 526 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 1390 aa  103  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3529  signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 405 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 		 815 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>