More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2819 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2819  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 597 aa  1198    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.753757 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2929  signal transduction histidine kinase  39.61 
 
 		 593 aa  330  4e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1271  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 		 593 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2724  signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 		 613 aa  322  9.999999999999999e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.524296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3564  signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 594 aa  320  6e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.186387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3834  signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 578 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.391649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2700  signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 		 592 aa  299  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3288  Signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 662 aa  152  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390564  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0092  signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 570 aa  121  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0277499 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 603 aa  120  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 746 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0051  signal transduction histidine kinase  23.66 
 
 		 585 aa  110  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725839 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 532 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 871 aa  108  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 		 348 aa  107  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4364  signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 807 aa  107  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.217771 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 348 aa  107  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.36 
 
 		 348 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  34.15 
 
 		 344 aa  105  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 790 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 354 aa  101  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 349 aa  101  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  32.54 
 
 		 783 aa  100  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 1093 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 815 aa  100  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 752 aa  100  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 1093 aa  100  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1636  two component sensor kinase  30.85 
 
 		 342 aa  99.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264656  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 362 aa  100  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 1654 aa  99.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 732 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 913 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 416 aa  99  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 439 aa  98.6  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 1560 aa  98.2  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 774 aa  97.8  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 215 aa  98.2  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 363 aa  98.2  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 1253 aa  97.8  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 613 aa  97.8  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 		 347 aa  97.8  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 681 aa  97.4  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 		 547 aa  97.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 874 aa  97.1  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 1183 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 362 aa  96.3  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 3706 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2023  signal transduction histidine kinase  24.22 
 
 		 596 aa  96.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.175935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 526 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  30.52 
 
 		 1239 aa  96.3  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 1093 aa  95.1  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1343  signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 350 aa  94.7  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.54395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 834 aa  94.7  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.86 
 
 		 895 aa  94.4  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 875 aa  94  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 771 aa  94  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0148  Signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 350 aa  93.2  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.332902  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 832 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  25.96 
 
 		 739 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 472 aa  92.8  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1781  signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 350 aa  93.2  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 362 aa  93.2  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 864 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  25.8 
 
 		 1182 aa  91.7  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 		 2693 aa  91.3  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 1676 aa  91.3  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 872 aa  90.9  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5952  signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 355 aa  91.3  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 767 aa  90.9  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 551 aa  90.9  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 757 aa  90.5  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 1246 aa  90.1  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  29.17 
 
 		 744 aa  89.4  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3926  signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 		 512 aa  89.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 361 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 362 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 360 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 648 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 813 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 723 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 1714 aa  87.8  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 585 aa  87.8  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08676  hypothetical protein  30.52 
 
 		 650 aa  87.8  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0972974  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 945 aa  87.8  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  26.51 
 
 		 754 aa  87.4  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 964 aa  87.4  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  25.62 
 
 		 991 aa  87.4  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 398 aa  87  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 382 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 945 aa  86.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 1051 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 1047 aa  86.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 932 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2333  signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 		 912 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 		 764 aa  86.3  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 788 aa  86.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 909 aa  85.1  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 674 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 1177 aa  84.7  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>