More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1343 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1343  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 350 aa  700    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.54395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0148  Signal transduction histidine kinase  87.03 
 
 		 350 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.332902  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1781  signal transduction histidine kinase  87.03 
 
 		 350 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  48.67 
 
 		 344 aa  310  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  42.03 
 
 		 348 aa  247  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 		 362 aa  245  6.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 		 362 aa  245  8e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  43.95 
 
 		 354 aa  243  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  43.47 
 
 		 349 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 		 362 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 		 360 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  40.06 
 
 		 363 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  42.98 
 
 		 348 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 		 348 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 361 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0664  Signal transduction histidine kinase  42.01 
 
 		 344 aa  225  8e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5952  signal transduction histidine kinase  43.02 
 
 		 355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2165  signal transduction histidine kinase  41.93 
 
 		 358 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2424  signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 		 354 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2333  signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 		 376 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 		 406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 		 387 aa  125  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 416 aa  122  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 		 382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 871 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  33.79 
 
 		 1239 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 		 874 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 414 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.56 
 
 		 1668 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 488 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 215 aa  116  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 875 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.68 
 
 		 1663 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.41 
 
 		 895 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 		 603 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 771 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 613 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  38.27 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 991 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 864 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  33.21 
 
 		 657 aa  113  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 		 381 aa  113  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 872 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 1560 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3686  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 709 aa  110  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206553 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 839 aa  110  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0255  sensor histidine kinase  32.43 
 
 		 480 aa  110  5e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 704 aa  109  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1894  PAS sensor protein  36.68 
 
 		 387 aa  109  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 2693 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 3706 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 1654 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 398 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 682 aa  106  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3288  Signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 662 aa  106  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390564  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 815 aa  106  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 		 721 aa  106  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0911916  normal  0.976086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 746 aa  106  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 526 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 547 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 674 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 400 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 1093 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1063  signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0212102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 767 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  29.19 
 
 		 1210 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2279  signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 392 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  41.54 
 
 		 739 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 752 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 572 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  33.67 
 
 		 744 aa  103  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 932 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 732 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 585 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 936 aa  102  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 739 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  29.21 
 
 		 754 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 941 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 964 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 532 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 1676 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2024  signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 497 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  0.406004 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  32.31 
 
 		 391 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 945 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 		 681 aa  100  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 1227 aa  100  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 472 aa  99.4  7e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 723 aa  99.4  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  27.72 
 
 		 449 aa  98.6  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 551 aa  99  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 545 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1476  signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 357 aa  98.2  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0180149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 913 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 1714 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3214  ABC-2 type transporter  33.76 
 
 		 540 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>