More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2333 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2333  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 376 aa  743    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  54.39 
 
 		 361 aa  348  6e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  53.37 
 
 		 360 aa  345  8e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  52.65 
 
 		 362 aa  344  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  52.81 
 
 		 363 aa  342  8e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  53.12 
 
 		 362 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  53.31 
 
 		 362 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5952  signal transduction histidine kinase  56.53 
 
 		 355 aa  332  7.000000000000001e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  52.16 
 
 		 362 aa  331  1e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  49.44 
 
 		 349 aa  297  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  48.57 
 
 		 354 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  47.18 
 
 		 348 aa  287  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  46.65 
 
 		 348 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  46.65 
 
 		 348 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  43.75 
 
 		 344 aa  253  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2165  signal transduction histidine kinase  42.82 
 
 		 358 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2424  signal transduction histidine kinase  42.25 
 
 		 354 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0664  Signal transduction histidine kinase  43.3 
 
 		 344 aa  240  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1343  signal transduction histidine kinase  40.73 
 
 		 350 aa  219  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.54395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0148  Signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 		 350 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.332902  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1781  signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 		 350 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 		 416 aa  147  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 1093 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 1093 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 771 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 414 aa  126  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3686  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 709 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 613 aa  126  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 347 aa  124  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 1093 aa  122  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 		 864 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 		 431 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 532 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  33.98 
 
 		 783 aa  120  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 461 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.34 
 
 		 1663 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 		 526 aa  119  9e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 603 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  32.27 
 
 		 744 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 3706 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1177 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 462 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 2693 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.4 
 
 		 1668 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 747 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 		 871 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 		 941 aa  116  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 746 aa  116  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3529  signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 405 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 1560 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4164  hypothetical protein  35.16 
 
 		 344 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 764 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 		 739 aa  115  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1063  signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0212102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 752 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 771 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 1051 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 721 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0911916  normal  0.976086 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  33.04 
 
 		 918 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 872 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 1676 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1670  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261958  normal  0.184327 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 551 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 1654 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 732 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 732 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0498  signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 		 420 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 815 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0255  sensor histidine kinase  27.72 
 
 		 480 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2279  signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 		 392 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 437 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  34.47 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1659  sensor histidine kinase  32.44 
 
 		 476 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0050  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.28 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  29.73 
 
 		 624 aa  108  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 648 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1607  sensor histidine kinase  32.44 
 
 		 437 aa  107  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1476  signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 357 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0180149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 749 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 774 aa  106  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 767 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 382 aa  106  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0327  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  32.68 
 
 		 400 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0659976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 964 aa  106  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 681 aa  106  8e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 465 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 		 524 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.82 
 
 		 381 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0092  signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 570 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0277499 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 439 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0054  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.55 
 
 		 467 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 832 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 874 aa  104  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 381 aa  104  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 1714 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>